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此文献中分子结MO计算是否合理?

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发布时间: 2022-3-2 15:57

正文摘要:

    一篇有关分子结的文献(Jia, C. C. et al. Covalently bonded single-molecule junctions with stable and reversible photoswitched conductivity. Science 352, 1443-1445, doi:10.1126/science.aaf ...

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wwjun 发表于 Post on 2022-3-3 09:10:36
sobereva 发表于 2022-3-2 20:37
6-311++g(3df, 3pd)是极度丑陋的基组,缺乏基组常识的人才会用这个
6-311g(3df,3pd)比def2-TZVPP更贵结果 ...

谢谢卢老师!
sobereva 发表于 Post on 2022-3-2 20:37:23
6-311++g(3df, 3pd)是极度丑陋的基组,缺乏基组常识的人才会用这个
6-311g(3df,3pd)比def2-TZVPP更贵结果还更差,毫无使用价值。当前研究根本没必要加弥散,而且还把通常很没意义的氢的弥散加了,更是瞎浪费计算时间,仔细看
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119

基组该用什么看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

文中瞎用一堆泛函也没什么意义。M11算什么都不灵,毫无考虑价值。M06-2X既不适合算轨道能量(gap过度高估)也不适合算电子光谱(磷光除外)
wwjun 发表于 Post on 2022-3-2 19:09:32
wzkchem5 发表于 2022-3-2 19:06
1. 这个计算应该计算的就是单独的分子的HOMO、LUMO。如果考虑石墨烯,那么整个体系的HOMO、LUMO可能都在石 ...

十分感谢
wzkchem5 发表于 Post on 2022-3-2 19:06:00
1. 这个计算应该计算的就是单独的分子的HOMO、LUMO。如果考虑石墨烯,那么整个体系的HOMO、LUMO可能都在石墨烯上面,因为石墨烯的gap为零,这样就失去这个计算的意义了。基底、酰胺键可能有少许影响,但大概率没有定性影响,所以假如你是审稿人,你提意见说让作者考虑酰胺键和基底再算一次也是合理的要求,但是如果没有审稿人提这条意见,客观来说作者不算也是可以接受的。
2. 不合适,极化函数和弥散函数加太多了。但是不影响结果的正确性(因为是加太多了而不是加太少了),只是白白浪费了一些机时而已。

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