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氢原子转移过程的产物能量比过渡态能量高

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发布时间: 2022-3-2 16:34

正文摘要:

各位老师好。 我在做某一个氢原子转移的反应(H2CrO4- + H → H3CrO4-)计算时发现产物的自由能比过渡态的自由能要高,下面两张图分别是过渡态和产物的结构,已经确定过渡态有唯一虚频,且虚频的振动方向为H原子在 ...

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yu0117153157 发表于 Post on 2022-4-20 10:13:10
催化氢转移吗
wudiazhu 发表于 Post on 2022-3-5 13:24:46
plus 发表于 2022-3-5 11:39
电子转移,质子转移
先补基础吧

好的老师,谢谢您!
plus 发表于 Post on 2022-3-5 11:39:46
wudiazhu 发表于 2022-3-5 10:29
抱歉老师我基础较薄弱,HAT是氢原子转移,这个et和pt是?

电子转移,质子转移
先补基础吧
wudiazhu 发表于 Post on 2022-3-5 10:29:24
plus 发表于 2022-3-5 07:59
看起来基态可能是et + pt的过程
即便是HAT的过渡态,H的自旋密度基本为0

抱歉老师我基础较薄弱,HAT是氢原子转移,这个et和pt是?
plus 发表于 Post on 2022-3-5 07:59:02
wudiazhu 发表于 2022-3-4 17:39
老师您好,我后来做了过渡态的自旋密度。体系alpha电子主要集中在Cr上,我是希望转移的H原子带单电子,从 ...

看起来基态可能是et + pt的过程
即便是HAT的过渡态,H的自旋密度基本为0
wudiazhu 发表于 Post on 2022-3-4 08:29:46
wzkchem5 发表于 2022-3-3 16:52
这个你必须结合你的具体体系来判断,只要你了解你的体系,你必然知道你的体系的前线轨道、自旋密度等长什 ...

好的谢谢老师!我试试看
wzkchem5 发表于 Post on 2022-3-3 16:52:23
wudiazhu 发表于 2022-3-3 03:24
感谢wzkchem5老师回复。大概懂了stable检验波函数稳定,但关于您后面说的,要如何从布局分析结果、前线轨 ...

这个你必须结合你的具体体系来判断,只要你了解你的体系,你必然知道你的体系的前线轨道、自旋密度等长什么样才是正常的,比如从共振式就可以分析得到。
wudiazhu 发表于 Post on 2022-3-3 10:24:38
wzkchem5 发表于 2022-3-3 00:03
嗯,stable必须做,但是stable结果稳定不代表波函数一定正确,因为同一个体系可能有不止一个稳定波函数, ...

感谢wzkchem5老师回复。大概懂了stable检验波函数稳定,但关于您后面说的,要如何从布局分析结果、前线轨道、自旋密度等确认体系波函数是否和预期相符呢,就比如我这个H原子转移过程,我理解是自旋密度应在转移的H原子上有单电子,不过布局分析、前线轨道等要符合一个什么特征才算正确的,这点还没用弄太明白。
wzkchem5 发表于 Post on 2022-3-3 00:03:39
wudiazhu 发表于 2022-3-2 16:54
感谢wzkchem5老师的建议,经检查,结构优化级别下产物能量要比反应物能量低。然后我突然发现我结构优化加 ...

嗯,stable必须做,但是stable结果稳定不代表波函数一定正确,因为同一个体系可能有不止一个稳定波函数,其中只有一个是正确的,必须从体系的布居分析结果、前线轨道、自旋密度等确认这个体系的波函数与你预期的相符
wudiazhu 发表于 Post on 2022-3-2 23:56:38
sobereva 发表于 2022-3-2 20:45
另外,这种问题应当带上DFT-D。直接用PBE0很容易挨批

感谢sob老师建议。
wudiazhu 发表于 Post on 2022-3-2 23:55:37
plus 发表于 2022-3-2 19:09
用的开壳层还是闭壳层,检查下自由基的自旋密度

plus老师您好,我过渡态是用的开壳层,产物用的闭壳层
wudiazhu 发表于 Post on 2022-3-2 23:54:16
wzkchem5 发表于 2022-3-2 18:59
先检查一下,结构优化所用级别下的产物能量是不是比反应物能量高。如果不是,那就是正常现象;如果是,那么 ...

感谢wzkchem5老师的建议,经检查,结构优化级别下产物能量要比反应物能量低。然后我突然发现我结构优化加了D3校正,但是算高精度单点忘记加D3校正了,我怀疑是这个原因,我姑且先带上D3校正算一下。您指的波函数正确与否是指的stable检验稳定性对吗?IRC我觉得是不是没必要做了,氢原子已经确定是在在两个氧原子间振动,反应物和产物都很清晰了。
sobereva 发表于 Post on 2022-3-2 20:45:12
另外,这种问题应当带上DFT-D。直接用PBE0很容易挨批

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