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使用CP2K结合Multiwfn绘制密度差图、平面平均密度差曲线和电荷位移曲线

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发布时间: 2022-3-10 11:00

正文摘要:

使用CP2K结合Multiwfn绘制密度差图、平面平均密度差曲线和电荷位移曲线Use CP2K combined with Multiwfn to plot density difference maps, plane averaged density difference curves and charge displacement curv ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-9-28 21:59:57
fd7 发表于 2024-9-28 17:58
老师,请问“C和O上的电子密度整体大幅减少,很大程度往Na的方向上转移了”这句话如果这样理解是否正确:电 ...

fd7 发表于 Post on 2024-9-28 17:58:01
老师,请问“C和O上的电子密度整体大幅减少,很大程度往Na的方向上转移了”这句话如果这样理解是否正确:电子流动方向是从CO流向了Na,Na的正电荷会降低。
bblovelp 发表于 Post on 2022-5-22 19:44:24
今天才发现 使用Multiwfn处理 cp2k-hartree-v_hartree-1_0 .cub文件获得平面平均曲线(plane-averaged curve)减去费米能就是功函数
sobereva 发表于 Post on 2022-5-6 09:17:23
yjb 发表于 2022-5-5 20:46
老师,Multiwfn可以画cp2k计算出来的cv的FES的图吗? 谢谢老师

不能
yjb 发表于 Post on 2022-5-5 20:46:11
老师,Multiwfn可以画cp2k计算出来的cv的FES的图吗? 谢谢老师

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静哥哥 发表于 Post on 2022-4-15 07:26:52
sobereva 发表于 2022-4-15 02:58
预计第四季度有
www.keinsci.com首页预告栏都体现得很清楚

好的,到时一定参加,谢谢卢老师
sobereva 发表于 Post on 2022-4-15 02:58:15
静哥哥 发表于 2022-4-14 17:15
好的,谢谢卢老师。今天翻看了您关于杂化的帖子,真是太佩服了。不知道卢老师近期有没有计划举办cp2k的培 ...

预计第四季度有
www.keinsci.com首页预告栏都体现得很清楚
静哥哥 发表于 Post on 2022-4-14 17:15:32
sobereva 发表于 2022-4-14 15:14
PBE0的HF杂化成份不是经验值,看原文,是理论推出来的。这点和很多其它泛函通过拟合、经验确定的HF成份截 ...

好的,谢谢卢老师。今天翻看了您关于杂化的帖子,真是太佩服了。不知道卢老师近期有没有计划举办cp2k的培训班?
sobereva 发表于 Post on 2022-4-14 15:14:08
静哥哥 发表于 2022-4-13 14:03
谢谢社长。
另外请教个问题,根据这个帖子https://www.cp2k.org/exercises:2015_ethz_mmm:tio2_gap
关 ...

PBE0的HF杂化成份不是经验值,看原文,是理论推出来的。这点和很多其它泛函通过拟合、经验确定的HF成份截然不同。
绝对不要用1,100% HF成份对于绝大多数问题都很不适合。
另外,那个网页里的做法属于拿可调参数凑数据,不建议那么搞。

HF成份是泛函直接定义的,看
不同DFT泛函的HF成份一览
http://sobereva.com/282http://bbs.keinsci.com/thread-807-1-1.html

适合用什么泛函看具体目的,比如对于带隙,HSE06就整体不错,而且是公认的,拿这个算带隙不会招致太大质疑。而自己凑一个HF成份,而且说不出来什么物理层面的意义,则明显更容易招质疑。
静哥哥 发表于 Post on 2022-4-13 14:03:45
sobereva 发表于 2022-4-13 01:41
估计是表面区域电子结构复杂导致的
可以试试不同切的方式(界面处的原子怎么归属给两部分)
也可以尝试 ...

谢谢社长。
另外请教个问题,根据这个帖子https://www.cp2k.org/exercises:2015_ethz_mmm:tio2_gap
关于PBE0杂化函数中的HFX交换系数,是一个半经验值,自己改变并使结构符合自己的目标能带值。比如fe2o3我用hfx=1能很好地模拟气电子结构,比如dos和gap。那么,对于fe3o4或者fe2o3的缺陷模型也能用1吗?我大概搜了下,好像不能直接用1。对于不同体系这个系数可能有出入,那么我该怎么处理这个系数呢。抱歉,这块理论比较欠缺,请社长解惑下
sobereva 发表于 Post on 2022-4-13 01:41:25
静哥哥 发表于 2022-4-12 21:22
社长大大:
    打扰了。我按照您的帖子重复了下您的文件,都没问题,能很好的得到差分电荷密度。
    但 ...

估计是表面区域电子结构复杂导致的
可以试试不同切的方式(界面处的原子怎么归属给两部分)
也可以尝试CP2K版块里讨论的帮助收敛的方法,之前我也回复过很多次
静哥哥 发表于 Post on 2022-4-12 21:24:20
上面的异质结切去一部分,我是随意切的,只是用于向您展示
静哥哥 发表于 Post on 2022-4-12 21:22:29
社长大大:
    打扰了。我按照您的帖子重复了下您的文件,都没问题,能很好的得到差分电荷密度。
    但是涉及我自己的异质结构建结区差分电荷密度就出现了问题。我首先构建了异质结C=A+B,类似tio2孪晶,是3d模型,用multiwfn得到c.inp文件,cp2k结构优化后,再用energy进行计算得到cube文件,几十步就收敛了,这里一切正常。然后,我用multiwfn显示异质结C,记下A和B的原子位置,在c.inp里分别删除A或B 的原子。再次进行计算,想得到B和A的cube文件。但是,我发现在A和B进行energy 计算是,SCF无法收敛,跑了几百步都不收敛,我分别调节了 算法,MIXING下的各个参数,发现A或B都无法收敛。我的inp文件是默认的pbe.inp文件,按理说就算只剩A或者B应该很快收敛,可是波动很大。对于计算差分电荷密度,我又不能对A或者B再次结构优化。
     我和另外一个老师讨论了半天,觉得是不是因为我是直接切割的3D模型的cif,产生了很多悬挂键,导致不收敛?请教社长大大,我该怎么处理

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sobereva 发表于 Post on 2022-3-18 16:05:19
今日对本文和Multiwfn程序进行了更新,将局部积分曲线和平面平均曲线做了区分,后者定义为前者除以截面面积。最新版Multiwfn的本文介绍的功能界面上已经多了计算plane-average curve的选项。

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