ljh123 发表于 2024-9-8 07:40 有没有可能是铁的自旋态选错了 |
wzkchem5 发表于 2024-9-8 14:20 感谢老师解答。我试了一下TDDFT确实能找到这个结构。但是我思考了一下又有了一个疑惑。因为高价铁的氧化还原电位是高于苯氧自由基的，所以这个反应的自由能变是小于o的，也就是说Fe(3价）+苯氧自由基的自由能低于四价铁+苯酚。而DFT是通过自洽场来分配电荷，也就是说会自动计算到能量最低的电子基态。 而后我用目前使用的B3LYP-D3泛函计算了四价铁和酚的氧化还原电位，发现对于酚误差不大，而四价铁误差极大。甚至出现了四价铁氧化还原电位小于酚的情况。 由上，能否认为这是因为B3LYP这个泛函有问题，定性都无法做到 |
ljh123 发表于 2024-9-8 04:54 可以，但注意泛函的适当选取，你要的态是CT态，HF exchange太小了算CT态不准，太高了算过渡金属不准 |
wzkchem5 发表于 2024-9-8 10:33 我看了一些文献，觉得一个可行的方法是这篇文献的J. Phys. Chem. A 2018, 122, 47, 9191–9198。应该就是用TDDFT优化出单电子转移后的激发态结构。因为我没用过TDDFT所以想问一下，TDDFT可以找到我想要的电子激发方式吗？也就是从苯酚转移到高价铁。这个是要一个态一个态的算，然后通过NTO来看轨道变化来找到对应的态吗（感觉这样会很花钱，因为是租的超算） |
wzkchem5 发表于 2024-9-8 10:33 其实我想优化的是产物的复合物。就是四价铁（氧化剂）通过单电子转移氧化了苯酚，生成了苯氧自由基和三价铁。在发生电子转移前，苯酚的羟基会和四价铁有弱相互作用。 |
ljh123 发表于 2024-9-7 17:15 你确定你要优化的这个电子结构是正确的基态电子结构吗 |
| 可以问问题主怎么解决这个问题的吗？而且我在优化类似结构的时候，发现总是优化成苯酚阴离子+低价金属离子，和自由基+高价金属离子的电荷和自选多重度都是一样的，不清楚该怎么优化成想要的样子 |
wzkchem5 发表于 2022-3-14 15:52 老师您好，最近我也在算一个和本贴极为类似的体系，但是是三价铁络合物（一个单电子）与苯酚自由基（PhO·，一个单电子），并且两者也是羟基氧和铁连接。我结构优化能顺利结束，但检查自旋密度的时候发现，这个结构被优化成四价铁络合物(两个单电子）+苯酚阴离子（PhO-)。可以看到两者的体系自旋多重度都是3，电荷也都一样，所以我想问问该怎么优化到我想要的苯酚自由基+三价铁络合物的结构呢。我尝试过片段组合波函数作初猜也没用 |
wzkchem5 发表于 2022-3-14 15:52 感谢指点，我按照示例研究研究。 |
小黑匣 发表于 2022-3-14 01:58 仿照http://sobereva.com/579的做法，用背景电荷描述固相环境对体系的作用。此外金属的第一配位层仍然需要显式描述，不管第一配位层是不是溶剂分子都是如此。 |
wzkchem5 发表于 2022-3-12 16:07 那如果这不是液相体系，是固相体系，是金属氧化物的话我也试过，仍然无法得到优化后的结构，您知道固相体系怎么处理吗？ |
sobereva 发表于 2022-3-13 07:30 好的，我再去试一下，谢谢sob老师。 |
|
解决SCF不收敛问题的方法 http://sobereva.com/61 量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法 http://sobereva.com/164 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2024-11-27 18:15 , Processed in 0.345001 second(s), 27 queries , Gzip On.
组图打开中，请稍候......
收藏 Add to favorites