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使用高斯优化一个铁氮掺杂的石墨烯结构掺入F或S原子的结构时一直报错

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发布时间: 2022-3-14 12:01

正文摘要:

软件:gaussian 16 C01,Linux平台 计算路径:先优化一个石墨烯结构,然后在优化好的石墨烯中用Fe原子和N原子取代中间的C原子,再次优化。                 再 ...

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guoguoping199 发表于 Post on 2022-3-14 18:34:40
wzkchem5 发表于 2022-3-14 16:23
首先确保你算的结构是合理的,只有合理的结构才可能保证SCF收敛。
石墨烯里面氟取代碳的缺陷不是1:1取代的 ...

好的,谢谢大佬,这个结构只是想预测一下看看能不能成,之前也没接触过类似的,犯低级错误了
wzkchem5 发表于 Post on 2022-3-14 16:23:28
首先确保你算的结构是合理的,只有合理的结构才可能保证SCF收敛。
石墨烯里面氟取代碳的缺陷不是1:1取代的,只能一对多取代,也就是需要同时拿掉好几个碳才能掺杂进一个氟,这个是但凡有一点有机化学基础就能搞清楚的问题,哪怕不懂有机化学,自己查一下文献也能知道文献用氟掺杂石墨烯是怎么掺杂的。类似地,石墨烯如果用硫按1:1取代碳,硫必须带一个正电,所以电荷要相应改变。
做掺杂计算最忌讳的就是假设所有缺陷都是1:1掺杂,诸如从石墨烯里抠掉一个碳原子直接往里放个Fe(实际应该抠掉相邻的两个碳原子),从g-C3N4里面的二级胺结构R-NH-R里抠掉一个氮原子往里放个氯(实际掺杂的时候应该断键,变成R-Cl H2N-R,或者R-Cl H-R),等等。其次忌讳的就是假设所有位点都可以掺杂任何元素。一定要充分地查文献,了解不同材料掺杂不同杂质的规律,再做计算,不是你在gaussview里随便把一个原子换成另一种元素就行的,那种做法对于氧族化合物、卤化物或许大多数时候成立,但是对于碳材料大多数时候是不成立的。对于石墨烯掺杂,还需要知道怎么画体系的共振式,只有共振式稳定的掺杂结构才是存在的。

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小墨 发表于 Post on 2022-3-14 14:56:34
有金属很正常,同楼上所言,一般来说有金属不太可能是完美的闭壳层,所以推荐先检查一下自旋多重度,多试几次。
yaoyuan0711 发表于 Post on 2022-3-14 14:39:17
参考http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html

“成因:SCF不收敛

解决方法:首先确保输入文件中存在#p而不是#(用#p不是为了解决不收敛本身,而是使Gaussian输出SCF的迭代过程,用以判断SCF不收敛属于哪种情况),然后阅读:http://sobereva.com/61(切勿到网上乱查“解决方法”,能有效解决的办法上文都有)”

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