求助：sobtop无法识别.mol2文件中的原子

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发布时间: 2022-3-16 15:53

利用单晶解析的软件生成了有机分子晶体的聚集体，想要利用gmx来计算的一下聚集体间的相互作用力，因每个分子的位置较为固定，所以想把该聚集体直接生成一个拓扑文件，但是却出现了如下报错无论用MS还是VMD生成 ...

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Rosefinch 发表于 Post on 2022-3-16 16:32:32

sobereva 发表于 2022-3-16 16:07
不要用什么JH01这种极为不规矩的原子名，判断不出来显然很正常
元素名前面别带着乱七八糟字符

好的，谢谢老师，它自己生成的，我去修改一下

sobereva 发表于 Post on 2022-3-16 16:07:33

不要用什么JH01这种极为不规矩的原子名，判断不出来显然很正常
元素名前面别带着乱七八糟字符

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