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计算腐殖酸静电势时使用iso命令报错,不显示分子结构周围的静电势分布

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发布时间: 2022-3-19 16:28

正文摘要:

参考的是http://sobereva.com/443这篇博文,其中pt和ext命令都能得到和博文中一样的效果图,当使用iso命令时,VMD显示窗口不显示静电势分布,命令输入窗口提示如下图

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sobereva 发表于 Post on 2022-4-12 01:42:45
supc 发表于 2022-3-25 12:03
老师您好,静电势图本身红蓝色,除了刻度以外还有其他别的含义嘛

我不理解你的意思
有了色彩刻度条,读者就能根据颜色判断分子表面上不同位置静电势数值是多大,没什么歧义
supc 发表于 Post on 2022-3-25 12:03:25
老师您好,静电势图本身红蓝色,除了刻度以外还有其他别的含义嘛
yulongzhanshen 发表于 Post on 2022-3-20 21:01:25
谢谢sob老师,问题解决了,是计算完pt.bat和iso.bat后在再打开VMD并输入iso就出现教程中的图片了。我之前是计算完pt.bat就在VMD中输入pt,并没有关闭VMD,然后计算完iso.bat,再在VMD中输入iso就出现描述的问题了。再次感谢sob老师的教程,一定要一字一句看。
sobereva 发表于 Post on 2022-3-20 18:23:41
提问时候说清楚VMD版本号
目前一定要用VMD 1.9.3
yulongzhanshen 发表于 Post on 2022-3-20 15:35:10
谢谢,我再仔细检查一遍安装和文件
Yan_njit 发表于 Post on 2022-3-20 12:02:05
本帖最后由 Yan_njit 于 2022-3-20 12:36 编辑

感觉是你的VMD安装不完整导致,可以检查一下VMD的版本号,确保与教程中的一致,另外也可以检查一下作图的文件是否计算完整

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