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镧系化合物使用SMD溶剂模型在ORCA与Gaussian计算溶解自由能截然不同

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发布时间: 2022-3-20 22:50

正文摘要:

本帖最后由 Satoru 于 2022-3-21 10:38 编辑 最近做了一点和镧系有关的机理...用某斯优化+ORCA单点,发现结果和实验不太对,排查问题的时候鬼迷心窍check了一下溶解自由能...发现某斯和ORCA用SMD算出来的溶解自由 ...

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Satoru 发表于 Post on 2022-3-22 14:47:30
hebrewsnabla 发表于 2022-3-22 14:37
高斯的极性部分用的半径见http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 153592&fromuid=5840

非极性部分用的 ...

我孤陋寡闻了...感谢!
上面的结果是只用了ModifySph改半径
hebrewsnabla 发表于 Post on 2022-3-22 14:37:21
本帖最后由 hebrewsnabla 于 2022-3-22 14:44 编辑
Satoru 发表于 2022-3-22 13:49
好像确实是两个程序La用的半径不一样导致的...
高斯用的半径找了一个半天没找到,于是把orca打印出的半 ...

高斯的极性部分用的半径见http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 153592&fromuid=5840

非极性部分用的半径在SMD原文里有。(实际上这部分参数没有对重元素做任何优化。有些程序里会采用和原文不同的半径,如NWCHEM,但是似乎没人知道到底靠不靠谱……)

ORCA的CPCM部分打印的应该是极性部分的半径。你在高斯里面怎么修改半径的?ModifySph只能修改极性部分的半径。

sobereva 发表于 Post on 2022-3-22 08:12:32
Satoru 发表于 2022-3-21 14:02
提高了格点(ultrafine和DefGrid3),ORCA关掉了RI和COSX,但是真空的能量还差了不到1 mHa...请问还需要 ...

还要考虑是否收敛到了相同的波函数
注意做波函数稳定性测试
检查输出文件里俩程序输出的构造空腔的原子半径,尤其是La、Lu的,有可能有明显差异
sobereva 发表于 Post on 2022-3-21 13:33:22
喵星大佬 发表于 2022-3-21 09:42
极性部分差距不大,问题出在非极性部分

LaCp3极性部分差距也很大
喵星大佬 发表于 Post on 2022-3-21 09:42:08
sobereva 发表于 2022-3-21 07:39
你先确保气相下两个程序的电子能量能基本对上,然后再对比溶剂模型。

也尝试在Gaussian里用CPCM

极性部分差距不大,问题出在非极性部分
sobereva 发表于 Post on 2022-3-21 07:39:46
你先确保气相下两个程序的电子能量能基本对上,然后再对比溶剂模型。

也尝试在Gaussian里用CPCM
并且注意程序计算时显示的构造溶质孔洞用的原子半径,看两个程序是否有明显差异;如果有,将半径统一,看是否差异变小。
wzkchem5 发表于 Post on 2022-3-21 01:50:16
Satoru 发表于 2022-3-20 16:08
抱歉是我疏忽了...某斯用的是def2-TZVPP,我再去重算一下。但是一些极化函数的差距似乎不会造成这么大的 ...

是不是还有其他的基组不统一问题,因为高斯基函数数目比orca少。。。
Satoru 发表于 Post on 2022-3-20 23:08:53
wzkchem5 发表于 2022-3-20 23:00
高斯和orca计算的基函数数目不一样,建议检查一下是不是基组输入的问题

抱歉是我疏忽了...某斯用的是def2-TZVPP,我再去重算一下。但是一些极化函数的差距似乎不会造成这么大的差别?
wzkchem5 发表于 Post on 2022-3-20 23:00:21
高斯和orca计算的基函数数目不一样,建议检查一下是不是基组输入的问题

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