Rosefinch 发表于 2022-4-9 16:38
在后续计算中对于这类问题又有一些新的疑问想请教一下，我在做有机分子在石墨基底上自组装时（将有机分子分 ...

相互作用能为x kJ/mol是指有1 mol当前体系时相互作用能为x kJ。当前体系变了，体系中相互作用的分子数不同，自然x会发生变化。kJ/mol是对于整个体系而言的，不是对于每个被吸附的分子而言的。

可以认为是当前结构下的相互作用能。如果要考虑完整，由于被吸附分子在游离状态下的平均能量和处于被吸附状态有所不同，这部分也应当考虑到吸附能里。

个人理解，吸附能单位的kJ/mol里面的/mol指的是每mol吸附剂（你的有机分子），而不是每mol石墨，所以和石墨基底的大小无关

范德华作用一般通过截断方式计算，被吸附物的原子如果与石墨的原子距离超过了cutoff就不计入相互作用能。

分子一般只算吸附能吧，kJ/mol*A^2 是表面能/表面张力/界面能的单位

EdwardLimit 发表于 2022-3-21 19:10
不能考虑单位表面积，你的吸附不是饱和吸附，吸附量是人为设定的

这个是根据真实的实验结果来搭的模型，但是只选取了最小的一个片段，那如果我按照实验结果铺满整个石墨基底构成了一个周期性体系，是否可以去考虑单位面积上的相互作用力呢？

不能考虑单位表面积，你的吸附不是饱和吸附，吸附量是人为设定的