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平面平均差分密度曲线图形绘制问题

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madhatter

发布时间: 2022-3-23 20:02

正文摘要:

本帖最后由 madhatter 于 2022-3-23 20:55 编辑 Zn002表面对尿素的吸附，做了平面平均差分密度曲线，选择a，Z轴全范围，再锌层底部出现莫名的电荷聚集，我按照的是sob老师的教程使用CP2K结合Multiwfn绘制密度差图 ...

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sobereva 发表于 Post on 2022-3-25 08:32:15

madhatter 发表于 2022-3-24 18:25
抱歉sob老师，我确认我的文件都是一致的，哪个uks应该是我后来在原文件改后又算的，每次算单点能，我都是 ...

可以增加Zn板厚度再试

可以

madhatter 发表于 Post on 2022-3-24 18:25:53

sobereva 发表于 2022-3-24 15:41
这和Multiwfn里选的绘图范围没关系。我用你的无SCCS的cub文件绘制了密度差，将等值面数值设到很小的0.00003 ...

抱歉sob老师，我确认我的文件都是一致的，哪个uks应该是我后来在原文件改后又算的，每次算单点能，我都是把输入文件中的原子删除然后算的，所以文件参数应该没问题。现在的问题是莫名的就是底部存在电子密度增加，我不清楚这个原因是什么，正常来说三四层的金属原子基本不会收到尿素的分子的影响，而且我优化过程一直是固定底层原子的，正常做吸附可能出现底部电子密度增加的现象吗？
目前如果我只设定底层原子到真空距离的平面平均差分密度曲线，舍弃近底层区域，是否可以，因为我只是要只管锌表面的吸附

sobereva 发表于 Post on 2022-3-24 15:41:35

这和Multiwfn里选的绘图范围没关系。我用你的无SCCS的cub文件绘制了密度差，将等值面数值设到很小的0.00003时，能明显看出底下就是有一块电子密度增加区域

我注意到你算Znurea的时候设了UKS，意义不明。求密度差的不同片段计算用的设置应当统一，免得其它效应对密度差产生贡献。

madhatter 发表于 Post on 2022-3-24 14:29:17

sobereva 发表于 2022-3-24 09:36
没你的cube文件我没法判断
压缩后传网盘贴链接我看看

链接：https://pan.baidu.com/s/1_4lVaJfqUyiS8Tq6lrxU0g
提取码：zuqr
里面又加sccs和没加sccs的文件，还有单点的输入输出文件
麻烦sob老师了

urea.inp

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ZN.inp

10.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

znurea.inp

10.87 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

sobereva 发表于 Post on 2022-3-24 09:36:22

没你的cube文件我没法判断
压缩后传网盘贴链接我看看

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