冰释之川 发表于 2022-3-29 12:42 你好,感谢解答。问题不出在我使用的泛函上。经过检查发现,我的红色过渡态计算有误,一些靠近中心金属的柔性结构的构象没有按最低的结构去做过渡态初猜。重新计算后红色线最高为7.0kcal/mol。 |
sobereva 发表于 2022-3-29 11:58 谢谢老师,我尝试画一下投影图 |
妙角不脆 发表于 2022-3-29 11:27 感谢回答 |
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本帖最后由 冰释之川 于 2022-3-29 12:49 编辑 你这能垒是在什么计算水平下得到的? 对于双分子反应体系,除非两分子能结合成非常稳定的复合物,否则,应当还是以两个分子自由能之和作为基准,因此红色路径能垒比黑色的高。有条件可以提高计算级别看看计算结果如何 |
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常有人用这种投影图分析位阻、中心金属附近的拥挤程度 使用Multiwfn绘制分子和固体表面的距离投影图 http://sobereva.com/589(http://bbs.keinsci.com/thread-21754-1-1.html) |
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空间位阻现在用的是有点像地理里面的等高线图。可以看看这篇文章。 DOI https://doi.org/10.1039/D1SC04969K |
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