GROMACS分析时RDF未出现很长收敛区，数据可以用吗？

查看数: 4967 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2022-4-1 08:56

大家好：我在计算两个O原子间的RDF，出现这样的情况，最后是到了1，但没有出现很长的收敛区间，这个数据可以用吗？谢谢~

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2022-4-2 00:11:54

如果操作正确，没必然问题
也可以用更大盒子，看到了3nm之后部分是否平滑收敛到1

蕊蕊花儿杰杰 发表于 Post on 2022-4-1 20:35:59

蕊蕊花儿杰杰发表于 2022-4-1 20:34
抱歉。体系是环糊精、水、醇。跑了60nsnpt，6nm的盒子。

计算的是环糊精羟基上的氧和醇羟基上的氧。非常感谢老师~

蕊蕊花儿杰杰 发表于 Post on 2022-4-1 20:34:37

sobereva 发表于 2022-4-1 14:24
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http:// ...

抱歉。体系是环糊精、水、醇。跑了60nsnpt，6nm的盒子。

sobereva 发表于 Post on 2022-4-1 14:24:33

在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

体系都不说清楚

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register