求助请问大家如何在MS中正确表示苯甲基自由基？

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发布时间: 2022-4-1 11:07

请问大家，我在Materials studio Dmol3模块中模拟自由基反应，上图是我建立的要参与反应的苯甲基自由基，但是我一选择自动成键，就成为下图所示情况，请问大家我该如何建立真正的苯甲基自由基?

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南晓 发表于 Post on 2022-4-1 16:36:04

chands 发表于 2022-4-1 15:43
没事的，苯环上就没有“纯粹”的单键双键，只要坐标相同就是同一种物质。
http://sobereva.com/414

感谢感谢我去看看

chands 发表于 Post on 2022-4-1 15:43:42

南晓发表于 2022-4-1 14:51
感谢，有一个问题这两个物质原子坐标一模一样，我该怎么确定参与反应的是苯甲基自由基，而不是另一种物质 ...

没事的，苯环上就没有“纯粹”的单键双键，只要坐标相同就是同一种物质。
http://sobereva.com/414

南晓 发表于 Post on 2022-4-1 14:51:40

Eudaimonia 发表于 2022-4-1 14:36
显示成什么键无意义，坐标文件一般只记录原子坐标

看着不舒服的话你为什么要点自动成键呢。。。。本身就 ...

感谢，有一个问题这两个物质原子坐标一模一样，我该怎么确定参与反应的是苯甲基自由基，而不是另一种物质？我比较菜，还请指教，感谢！

Eudaimonia 发表于 Post on 2022-4-1 14:36:42

显示成什么键无意义，坐标文件一般只记录原子坐标

看着不舒服的话你为什么要点自动成键呢。。。。本身就是苯甲基自由基了

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