计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

利用ORCA5.0.1做钙离子及结合位点复合物的簇方法分析,一些疑问

查看数: 4403 | 评论数: 6 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2022-4-12 21:11

正文摘要:

     老师们晚上好,这两天在用ORCA5.0.1做钙离子以及结合位点复合物的簇分析,参照社长博文 http://sobereva.com/597 对截断区加氢并固定,考虑溶剂效应,做几何优化。然而不管怎么调试,总是 ...

回复 Reply

uenh1998 发表于 Post on 2022-4-13 15:03:42
sobereva 发表于 2022-4-13 14:07
取两瓣完全没必要,两部分又没什么相互作用,拿两部分研究和拿一部分研究得到的信息不会有差别,后者还便 ...

谢谢社长!取一瓣来研究,目前ORCA能跑起来了
sobereva 发表于 Post on 2022-4-13 14:07:12
uenh1998 发表于 2022-4-13 09:04
我研究的是这样的结构,所以取簇的时候,才看起来是两瓣。

取两瓣完全没必要,两部分又没什么相互作用,拿两部分研究和拿一部分研究得到的信息不会有差别,后者还便宜得多
uenh1998 发表于 Post on 2022-4-13 09:01:18
wzkchem5 发表于 2022-4-12 21:41
这不是SCF不收敛,而是OpenMPI报错。只有打印出很多行SCF能量结果,并且报错信息明确提到not converged之类 ...

谢谢老师,我试试
sobereva 发表于 Post on 2022-4-13 01:18:17
你的结构很奇怪,明显分成两瓣
对于优化来说计算级别倒是没什么问题。
wzkchem5 发表于 Post on 2022-4-12 21:41:06
这不是SCF不收敛,而是OpenMPI报错。只有打印出很多行SCF能量结果,并且报错信息明确提到not converged之类字眼,才是SCF不收敛。
检查OpenMPI有没有安装对,并且按照https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=9&t=7566这个帖子里的回帖的方法依次尝试,如果这个主题帖里提到的所有方法都不行,再来问

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-25 05:33 , Processed in 0.165245 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list