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求助:为什么MS数据库中的聚乙烯链和自己构建的聚乙烯链有差异,如何选择?

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发布时间: 2022-4-13 10:06

正文摘要:

各位前辈,在构建聚乙烯链的时候发现MS数据库中带有聚乙烯链,但是其和自己构建的结构有所不同(先对重复单元进行结构优化后构建的聚乙烯链也不相同),请问为什么会有这种差异,应该选择哪种方式更为合适,在此感谢前 ...

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风起于夏 发表于 Post on 2022-4-13 12:39:42
swordshine 发表于 2022-4-13 12:19
构象问题,一般应该用all-trans构象,能量最低;你自己构建的那个是gauche构象,能量会高一点。

好的,感谢您的解惑,我再了解一下您说的构象
风起于夏 发表于 Post on 2022-4-13 12:38:46
AaronO_o 发表于 2022-4-13 11:28
聚乙烯没有立构差异;我认为您和MS构建的模型差异是重复单元中不同头尾原子带来的构象差异,二者是相同的。 ...

是的,我也发现了和您说的一样的现象,但是不知道用哪个,所以就发了这个帖子。
风起于夏 发表于 Post on 2022-4-13 12:37:39
牧生 发表于 2022-4-13 10:41
你尝试一下找MS自带的聚苯乙烯,然后你就会知道,自己才是可信的。

好的,感谢前辈的解惑
swordshine 发表于 Post on 2022-4-13 12:19:05
构象问题,一般应该用all-trans构象,能量最低;你自己构建的那个是gauche构象,能量会高一点。
AaronO_o 发表于 Post on 2022-4-13 11:28:38
聚乙烯没有立构差异;我认为您和MS构建的模型差异是重复单元中不同头尾原子带来的构象差异,二者是相同的。

如果将您的重复单元中紫色标记H原子指定为右下角的那个H原子,我猜测您会得到和MS数据库相同的构象。
牧生 发表于 Post on 2022-4-13 10:41:24
你尝试一下找MS自带的聚苯乙烯,然后你就会知道,自己才是可信的。

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