wzkchem5 发表于 2026-5-18 10:19 收到,谢谢王老师指点。 |
xxtnenu 发表于 2026-5-18 10:06 键解离能为负是有可能的。如果目的是衡量键解离的难易,且键解离有过渡态,那么应该看活化自由能。 可以,主要需要留意自旋多重度正确不代表波函数正确,必须检查波函数的正确性 |
wzkchem5 发表于 2026-5-16 08:26 老师我还想请教一下,我算键解离能(化合物【A(BC)】和化合物A和化合物(BC)都进行了结构优化,算的ΔH)和键解离自由能均出现了负值,我在想是不是重排或形变导致的。然后我做柔性扫描发现先是一段吸热A和(BC)拉开距离,后面有的部分重新成键了开始放热(BC成键)(如20#的图)这种情况我能否比较柔性扫描中最高点来说明问题呢? 2.对于您上条提到的“(看哪个自旋多重度的能量最低”,对于产物的热力学最稳定,请问能否计算出所有片段的所有不同电荷和自旋多重度的吉布斯自由能,计算片段与反应物吉布斯自由能变的最小值进行比较说明呢? |
wzkchem5 发表于 2026-5-16 08:26 明白了,谢谢王老师。 |
xxtnenu 发表于 2026-5-16 03:18 这里需要确认你想知道的是刚解离开的产物的自旋多重度,还是产物的热力学最稳定的自旋多重度。前者比较麻烦,需要算ISC速率等,后者按一般确认自旋多重度的方式来确认即可(看哪个自旋多重度的能量最低,注意确认计算收敛到了正确的波函数),无需做势能面扫描 |
wzkchem5 发表于 2022-5-5 02:15 请问王老师,学生目前不确定断键后的产物和产物的自旋多重度,因此想进行柔性扫描考察断键过程。1.请问如何确定断键后的自旋多重度和分析电子转移过程呢?是否是将键长扫到足够远,或在扫描过程中选择几个构象,对该结构进行一些电子结构的可视化分析?2.在进行柔性扫描过程中由于一部分基团出现形变或电子重排或其他相互作用导致整体能量突然下降时如何理解呢?在该过程中又没有找到过渡态的话也很难与其他路径的动力学进行对比? |
202605160318021211..png (46.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)
wzkchem5 发表于 2026-3-25 17:47 明白了,谢谢老师 |
pikachuupup 发表于 2026-3-25 17:24 对,但注意缩写为NAMD的术语不是唯一的,有一个软件也叫NAMD,但和非绝热动力学没有关系。 Gaussian搭配Newton-X等可以跑,ORCA搭配SHARC等可以跑,不搭配这些额外的非绝热动力学都跑不了 |
wzkchem5 发表于 2022-4-15 14:18 “衡量光解离的难易程度,最严格的方法就是跑非绝热动力学,统计断不同键的产物比例。”请问老师,这里的非绝热动力学指的就是跑NAMD吗,Gaussian或者ORCA能不能跑呢? |
wzkchem5 发表于 2022-5-5 17:31 明白了 谢谢 |
betsy 发表于 2022-5-5 10:00 这就体现了势能面扫描的作用,激发态解离可能生成基态的自由基,也可能生成激发态的自由基。如果已知是生成基态还是激发态、如果是激发态的话是第几个激发态,那直接按定义算BDE就行了,不需要势能面扫描;否则就需要做势能面扫描,确认你研究的激发态到底是解离成什么电子态的自由基,然后再按定义算BDE。 |
本帖最后由 betsy 于 2022-5-5 17:10 编辑 wzkchem5 发表于 2022-5-5 02:15 好的 谢谢。想问下激发态时的BDE怎么计算呢? 当分子分裂成自由基后,自选多重度为2,那如何区分基态和激发态呢? 有点迷惑 |
betsy 发表于 2022-5-4 15:52 所以如果你的唯一目的就是算BDE,而且已知断键的产物,那么是不需要做势能面扫描的。 做势能面扫描在某些情况下是需要的,包括:(1)确定断键有没有能垒;(2)确定断键的时候两个产物各分得几个电子,尤其是对于光化学断键反应,常常需要做势能面扫描才能知道是均裂还是异裂;(3)对断键的过程进行进一步分析,例如判断是不是协同异步反应、分析电子是怎么转移的等等。 |
wzkchem5 发表于 2022-5-4 22:43 谢谢!如果时这样的话有点不是很理解坐势能面扫描的意义。因为如果分开优化的话,我们可以直接人为将分子分成两个自由基然后计算。那势能面扫描的意义是进一步判断么? |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2026-6-2 04:42 , Processed in 0.176169 second(s), 25 queries , Gzip On.