wzkchem5 发表于 2026-3-25 17:47 明白了，谢谢老师 |
pikachuupup 发表于 2026-3-25 17:24 对，但注意缩写为NAMD的术语不是唯一的，有一个软件也叫NAMD，但和非绝热动力学没有关系。 Gaussian搭配Newton-X等可以跑，ORCA搭配SHARC等可以跑，不搭配这些额外的非绝热动力学都跑不了 |
wzkchem5 发表于 2022-4-15 14:18 “衡量光解离的难易程度，最严格的方法就是跑非绝热动力学，统计断不同键的产物比例。”请问老师，这里的非绝热动力学指的就是跑NAMD吗，Gaussian或者ORCA能不能跑呢？ |
wzkchem5 发表于 2022-5-5 17:31 明白了 谢谢 |
betsy 发表于 2022-5-5 10:00 这就体现了势能面扫描的作用，激发态解离可能生成基态的自由基，也可能生成激发态的自由基。如果已知是生成基态还是激发态、如果是激发态的话是第几个激发态，那直接按定义算BDE就行了，不需要势能面扫描；否则就需要做势能面扫描，确认你研究的激发态到底是解离成什么电子态的自由基，然后再按定义算BDE。 |
本帖最后由 betsy 于 2022-5-5 17:10 编辑 wzkchem5 发表于 2022-5-5 02:15 好的 谢谢。想问下激发态时的BDE怎么计算呢？ 当分子分裂成自由基后，自选多重度为2，那如何区分基态和激发态呢？ 有点迷惑 |
betsy 发表于 2022-5-4 15:52 所以如果你的唯一目的就是算BDE，而且已知断键的产物，那么是不需要做势能面扫描的。 做势能面扫描在某些情况下是需要的，包括：（1）确定断键有没有能垒；（2）确定断键的时候两个产物各分得几个电子，尤其是对于光化学断键反应，常常需要做势能面扫描才能知道是均裂还是异裂；（3）对断键的过程进行进一步分析，例如判断是不是协同异步反应、分析电子是怎么转移的等等。 |
wzkchem5 发表于 2022-5-4 22:43 谢谢！如果时这样的话有点不是很理解坐势能面扫描的意义。因为如果分开优化的话，我们可以直接人为将分子分成两个自由基然后计算。那势能面扫描的意义是进一步判断么？ |
betsy 发表于 2022-5-4 15:22 分开优化 因为键的断裂是一个连续的过程，不是说拉长到一定长度就突然从“没断”变成“断了”。只有扫到无穷远，才是真的完全断开了，否则只能说断得相对比较彻底或者不是那么彻底。但是没有任何软件能在有限的计算时间内扫到无穷远，所以只能是你人为把两个片段分开算，然后加起来 |
| 谢谢。如果要计算解离能的话，是根据势能曲线看键刚断开时的能量，然后减去基态时的能量吗？还是说键断开后得到两个片段分开优化，之后按照公式计算呢？十分感谢~~ |
betsy 发表于 2022-5-2 21:56 看起来就是绘制解离的势能曲线，拉长解离的键做柔性扫描 |
| 楼主您好！我目前也想要计算有机分子其中一个键的BDE，有两个问题想向您请教一下：（1）表格中分子的电荷是如何添加的？（2）文献中先对分子做了结构优化（开壳层），之后进行势能面扫描，想问下通过这种方法如何求键的解离能呢？我只知道键解离能通过分子片段的焓值minus整理的焓值计算得到。新手刚学，谢谢指导，万分感谢。。 |
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wzkchem5 发表于 2022-4-15 16:31 谢谢，我明白了，感谢您的分享 |
农夫山泉 发表于 2022-4-15 08:52 我知道了，所以你这里涉及两个过程：（1）光电离；（2）离子的键解离。光电离以后可能得到离子的基态，也可能得到离子的激发态，严格的做法是先探究得到的是离子的哪个电子态，再做计算。 碎片的出现顺序和BDE的关系确实相对速率常数和BDE的关系更密切一些，但是仍然不是绝对的。这种情况下用BDE可以说明一些问题，但是不够出彩，更严格的办法还是跑AIMD，其中为了简化起见可以不跑非绝热动力学，而是假设电子态为基态，光电离时多余的能量转化为离子的振动能。Stefan Grimme发展过这种计算方法（计算EI质谱的，但是原则上也适用于光电离），你可以查一下他的文章 |
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