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CP2k在进行晶体激发态计算时在算到TDDFPT WAVEFUNCTION OPTIMIZATION 报错

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Larry2022

发布时间: 2022-4-15 13:53

正文摘要:

本帖最后由 Larry2022 于 2022-4-22 10:38 编辑利用Sob老师的帖子，我已在服务器上手动编译了CP2K，最近在进行晶体的激发态计算时，总是会在TDDFPT WAVEFUNCTION OPTIMIZATION 这一步报错，同时错误原因都是 “P ...

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Larry2022 发表于 Post on 2022-4-27 12:03:09

本帖最后由 Larry2022 于 2022-4-27 12:04 编辑

sobereva 发表于 2022-4-27 06:58
已经说了，减小并行进程数。要么用PSMP版通过OpenMP并行来避免内存高消耗

我自己摸索了一下，已经知道该怎么启动混合并行计算了，多谢sob。（方便其他有此疑问的同学，我简单说明一下 1：OMP_NUM_THREADS=5 2： mpirun -np 6 cp2k.psmp xxx.inp |tee xxx.out）

Larry2022 发表于 Post on 2022-4-27 11:49:28

sobereva 发表于 2022-4-27 06:58
已经说了，减小并行进程数。要么用PSMP版通过OpenMP并行来避免内存高消耗

谢谢sob，想问一下PSMP版MPI+OpenMP混合并行的启动命令该怎么写呢？比方说6个MPI进程，每个MPI进程下属5个OpenMP线程，共计调用6*5=30个核。CP2K接触不多，求教一下。

sobereva 发表于 Post on 2022-4-27 06:58:32

Larry2022 发表于 2022-4-22 10:30
谢谢sob老师。根据你的建议，我回去将你给的例子跑了一次，发现能正常跑完。而后，我分别使用DZVP-MOLOPT ...

已经说了，减小并行进程数。要么用PSMP版通过OpenMP并行来避免内存高消耗

Larry2022 发表于 Post on 2022-4-22 10:30:56

本帖最后由 Larry2022 于 2022-4-22 10:44 编辑

sobereva 发表于 2022-4-15 16:49
给你移动了

谢谢sob老师。根据你的建议，我回去将你给的例子跑了一次，发现能正常跑完。而后，我分别使用DZVP-MOLOPT-SR-GTH和TZVP-GTH来计算自己的晶体，但皆会报错，而我们这台服务器的内存共计256GB，为了方便纠错我已将PRINT_LEVEL_MEDIUM的out文件和晶体结构给出，希望能推荐个更小但精度还行的基组或者其他解决办法，真的万分感谢。

sobereva 发表于 Post on 2022-4-15 16:49:29

Larry2022 发表于 2022-4-15 14:11
抱歉请问怎么删除这个帖子，我去第一性原理板块再发一次

给你移动了

如果下文的例子能正常跑完，你的报错也许是内存不够。减小基组，或减小并行进程数再试试。也可以尝试PRINT_LEVEL LOW改为PRINT_LEVEL MEDIUM输出更多信息看是否有什么端倪。
使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和考察电子激发态
http://sobereva.com/634（http://bbs.keinsci.com/thread-28006-1-1.html）

Larry2022 发表于 Post on 2022-4-15 14:11:50

jiangning198511 发表于 2022-4-15 14:05
首先 CP2K在第一性原理板块
其次你有没有尝试一下先跑跑程序自带的例子看能否正常运行

抱歉请问怎么删除这个帖子，我去第一性原理板块再发一次

jiangning198511 发表于 Post on 2022-4-15 14:05:35

首先 CP2K在第一性原理板块
其次你有没有尝试一下先跑跑程序自带的例子看能否正常运行

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