计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn) › 使用Mutiwfn计算分子尺寸遇到问题

使用Mutiwfn计算分子尺寸遇到问题

查看数: 5597 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

sun877469558

发布时间: 2022-4-19 15:10

正文摘要:

按照sob老师博文“使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分子的主轴”（http://sobereva.com/426）计算分子尺寸选择2 Export the geometry in new orientation as new.pdb in current folder 在使用VMD载入Mu ...

回复 Reply

sun877469558 发表于 Post on 2022-4-19 22:34:22

sobereva 发表于 2022-4-19 18:53
毫无问题

感谢sob老师，抱歉，犯这样的低级错误，确实是少打了空格

sobereva 发表于 Post on 2022-4-19 18:53:10

毫无问题

8成是你把博文里的命令粘贴到VMD文本窗口之后没按回车，导致最后一个命令没执行

sun877469558 发表于 Post on 2022-4-19 18:45:00

sobereva 发表于 2022-4-19 17:20
先更新到Multiwfn最新版本，如果还有问题，把输入文件上传

老师，您好，Multiwfn已经更新到 Version 3.8(dev), release date: 2022-Apr-13，结果如上图一样，以下是size命令后的结果

Farthest distance: 31(H )  --- 32(H ): 11.900 Angstrom
vdW radius of 31(H ): 1.200 Angstrom
vdW radius of 32(H ): 1.200 Angstrom
Diameter of the system: 14.300 Angstrom
Radius of the system:    7.150 Angstrom
Length of the three sides: 14.218    8.879    6.949 Angstrom

Naringenin.pdb

3.24 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

sobereva 发表于 Post on 2022-4-19 17:20:32

先更新到Multiwfn最新版本，如果还有问题，把输入文件上传

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register