请问如何分别获得体系特定分子密度在x，y，z方向上的分布？

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发布时间: 2022-4-25 11:03

请问各位老师，gromacs中有命令能分析体系特定分子的密度分别在下x，y，z方向上的变化? 如下图所示是某篇文献中分别分析了PMMA和CO2密度在xyz方向上的变化。还是说我应当编写VMD脚本，比如将盒子x方向上的边 ...

回复 Reply

高处裹棉被 发表于 Post on 2022-4-25 14:07:30

谢谢各位老师解答

丁越 发表于 Post on 2022-4-25 13:31:21

你多虑了，取样区间划分成a<=x<b 不就行了，另外注意区间数目，要能把最后一帧的点也包含进去

Lacrimosa 发表于 Post on 2022-4-25 12:47:50

gmx density即可实现

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