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cp2k QMMM PBE+def2- 震荡不收敛

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yinxing

发布时间: 2022-4-25 17:19

正文摘要:

本帖最后由 yinxing 于 2022-4-26 14:37 编辑 [size=0.92857em]@sobereva 卢老师您好，我参考https://www.cp2k.org/howto:biochem_qmmm 的例子，通过QMMM研究镧离子对蛋白酶催化活性的影响。复合物系统采用Ambert ...

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yinxing 发表于 Post on 2022-4-25 19:58:47

beyond 发表于 2022-4-25 18:30
QMMM的equilibration你是怎么做的啊， minimization 还是annealing？
def2- 是全电子基组，可以检查下设置 ...

非常感谢提醒，鉴于项目要求。equilibration用的是minimization.基组为def2-SVP。能量从开始运行始终在正负4.0左右震荡。如果乐意帮忙的话可以加我微信18810617756，将不胜感激。

beyond 发表于 Post on 2022-4-25 18:30:29

QMMM的equilibration你是怎么做的啊， minimization 还是annealing？
def2- 是全电子基组，可以检查下设置是否正确。。。
权限太高，下载不了附件。。。

话说，pdb id 都给出来了，就没有必要加这么高的权限限制吧。。。

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