如何读懂gromacs中oplsaa力场ffbondtypes.itp中的原子名称和命名规则

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发布时间: 2022-5-1 21:27

各位大佬请问一下，在oplsaa力场的atp文件中，给出的原子类型opls_XXX（序号），从原子类型去找成键信息的bondtypes时，显示的链接关系是C*，C_2， C_3, CT_2, CM, C, ...

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sobereva 发表于 Post on 2022-5-3 11:34:33

tangzi_via 发表于 2022-5-2 16:14
感谢sob老师百忙之中的回复，老师请问一下这个bond_type中的C*，C_2， C_3, CT_2, CM, C, C这些是什 ...

用于指认成键参数的原子类型

tangzi_via 发表于 Post on 2022-5-2 16:14:43

sobereva 发表于 2022-5-2 11:06

感谢sob老师百忙之中的回复，老师请问一下这个bond_type中的C*，C_2， C_3, CT_2, CM, C, C这些是什么意思呢？

sobereva 发表于 Post on 2022-5-2 11:06:46

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