packmol+gromacs模拟PbSO4在离子液体中的运动，应该选用哪个方式

查看数: 2830 | 评论数: 1 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2022-5-4 22:36

我要模拟的是PbSO4在离子液体中的运动。现有两种思路，一个是将离子液体建模成功后，进行100ns模拟。然后再将PbSO4扔进盒子模拟100ns 另一种是建模的时候就将离子液体和PbSO4一起建模，直接模拟100ns。请教下各 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2022-5-5 08:36:19

1 两种都可以，平衡完了都一样
第二种更划算点，监控平衡过程，一旦达到平衡就可以收集数据了。省得先去专门跑离子液体

2 如果你是指阴离子在水的一侧，阳离子在水的另一侧，明显不行。带相同电荷离子间巨大的静电互斥会导致模拟崩溃

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register