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请问如何判断这两条路径的优劣

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发布时间: 2022-5-5 20:05

正文摘要:

在计算过程中(热催),得到了这样两条反应路径,红线在势能面上的位置更靠上,但能垒比较低,绿线在势能面上的位置更靠下,但能垒较高,请问哪条路径更优呢? 希望能够得到各位老师的帮助,谢谢了

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wzkchem5 发表于 Post on 2022-11-16 15:07:38
Riszzz 发表于 2022-11-16 04:09
老师您好,最近在使用能量跨度模型时要到了一个问题,想请教您一下。
在反应吉布斯自由能大于0的情况下 ...

按简化前的公式算,或者先按简化后的公式算逆反应的TOF,再按精细平衡原理算出正反应TOF
此外需要注意,你要算的是正反应本身,还是正反应速率减去逆反应速率。如果是后者的话,还需要知道实验条件下产物的稳态浓度才行。

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Riszzz 发表于 Post on 2022-11-16 11:09:10
wzkchem5 发表于 2022-5-5 21:00
按https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ar1000956的方法分别计算两条路径的总活化自由能,总活化自由能比较低 ...

老师您好,最近在使用能量跨度模型时要到了一个问题,想请教您一下。
在反应吉布斯自由能大于0的情况下,该怎么计算TOF呢,简化后的TOF公式还适用吗?如果使用未简化的公式,得到的TOF是负数,这代表什么呀?
希望能得到您的回复,谢谢您了!
orangesea 发表于 Post on 2022-5-9 23:10:37
sobereva 发表于 2022-5-9 23:03
1 也得看这样的中间体参与的其它反应的势垒如何,看情况。
往往也可以把两个中间体取其中最低的那个当做 ...

谢谢老师的解答
sobereva 发表于 Post on 2022-5-9 23:03:12
orangesea 发表于 2022-5-8 21:46
老师您好 对于concvar模拟有些疑问
1.在利用concvar分析时,stepsize是由能垒最小的步骤所决定的
如果 ...

1 也得看这样的中间体参与的其它反应的势垒如何,看情况。
往往也可以把两个中间体取其中最低的那个当做一个处理

2 是
orangesea 发表于 Post on 2022-5-8 21:46:47
本帖最后由 orangesea 于 2022-5-8 22:59 编辑
sobereva 发表于 2022-5-6 18:59
合并int,只保留一个

老师您好 对于concvar模拟有些疑问
1.在利用concvar分析时,stepsize是由能垒最小的步骤所决定的
如果反应中两个中间体之间的能垒较小,比决速步小10kcal/mol以上,如果按照最小能垒设定stepsize,几乎不能模拟出整个反应,是否对于这样的情况,只要能垒比决速步少了10kcal/mol以上(即是绝对来说这个能垒并不小),均可认为它满足玻尔兹曼分布,从而用$Boltzmann关键词来“连接”两个中间体?
2.对于催化循环,是否只要用$fix将两端的催化剂浓度设为一样的定值即可?(假设催化剂没有被损耗)

wzkchem5 发表于 Post on 2022-5-8 18:20:25
Riszzz 发表于 2022-5-8 10:59
老师您好,请问如果整个势能面最低点为产物,那么可以选择产物为TDI吗

不能。仔细看TDI的定义,TDI不一定是势能面最低点
Riszzz 发表于 Post on 2022-5-8 18:01:44
sobereva 发表于 2022-5-6 13:29
红线容易进行
参看
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生

谢谢老师,还有个问题想请教老师,根据https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ar1000956这篇文章中的方法计算总活化自由能时,如果整个势能面最低点为产物,可以选择产物为TDI吗
Riszzz 发表于 Post on 2022-5-8 17:59:56
wzkchem5 发表于 2022-5-5 21:00
按https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ar1000956的方法分别计算两条路径的总活化自由能,总活化自由能比较低 ...

老师您好,请问如果整个势能面最低点为产物,那么可以选择产物为TDI吗
sobereva 发表于 Post on 2022-5-6 18:59:48
orangesea 发表于 2022-5-6 15:01
老师您好 请问concvar对于连续的Int 应该怎么输入$link信息?

合并int,只保留一个
orangesea 发表于 Post on 2022-5-6 15:01:04
sobereva 发表于 2022-5-6 13:29
红线容易进行
参看
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生

老师您好 请问concvar对于连续的Int 应该怎么输入$link信息?
sobereva 发表于 Post on 2022-5-6 13:29:06
红线容易进行
参看
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html

也可以用concvar进行浓度的模拟得到结论
http://sobereva.com/soft/concvar
Riszzz 发表于 Post on 2022-5-5 21:12:17
wzkchem5 发表于 2022-5-5 21:00
按https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ar1000956的方法分别计算两条路径的总活化自由能,总活化自由能比较低 ...

好的好的,谢谢老师
wzkchem5 发表于 Post on 2022-5-5 21:00:51
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ar1000956的方法分别计算两条路径的总活化自由能,总活化自由能比较低的更优

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