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季铵与氢氧根的SN2反应中,氢氧根应当怎样设置显式溶剂模型?

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发布时间: 2022-5-11 18:13

正文摘要:

本帖最后由 StormSpirts 于 2022-5-11 18:16 编辑 大家好,如图是我的体系。 这个反应在没有加显式水模型时,氢氧根甚至会和甲基上的氢反应,所以溶剂模型对这个反应非常重要。 我的疑惑是: 1. 应当只使 ...

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sobereva 发表于 Post on 2022-10-27 05:12:25
StormSpirts 发表于 2022-10-26 20:55
卢老师好,我还有个疑问想确定一下。

如果带上显式溶剂计算了TS,那么计算自由能垒时,自由能的各项也 ...


不过有必要的时候,DMP+也需要考虑显式溶剂

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StormSpirts 发表于 Post on 2022-5-11 18:25:26
sobereva 发表于 2022-5-11 18:21
1 同时考虑。尤其是显式溶剂越少,对溶质包裹越不充分,带上隐式溶剂模型的意义越高。本身带上隐式溶剂模型 ...

非常感谢卢老师!
sobereva 发表于 Post on 2022-5-11 18:21:41
1 同时考虑。尤其是显式溶剂越少,对溶质包裹越不充分,带上隐式溶剂模型的意义越高。本身带上隐式溶剂模型对耗时增加也不多,没理由不带上。而且氢氧根又是带负电的体系,更应该带上。

2 至少带一个。有余力的话可以再尝试多带一个,看看过渡态结构、势垒等产生的影响,确定必要性

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