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求助水化聚酰胺NPT模拟一段时间后聚合物分散了

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发布时间: 2022-5-13 17:43

正文摘要:

初始模型是通过将两个水盒和含水的聚酰胺膜拼接在一起够成的,经过120ns的npt模拟后,聚酰胺膜变得分散,没有保持初始的聚集状态。 聚酰胺膜在水中会发生溶胀 密度会变大 但是在这边模拟的状态没有办法和其他文献对 ...

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naoki 发表于 Post on 2024-7-23 20:04:19
建模不太对
cgy 发表于 Post on 2024-7-23 18:03:58
您好,请问您用GAFF力场产生拓扑文件的时候没有缺失键的信息吗,请问您用的哪个软件生成的itp文件,谢谢您
leonardomessi 发表于 Post on 2022-6-3 18:55:57
你的模型是错的,交联膜必须与镜像也发生交联
hymn 发表于 Post on 2022-5-25 15:18:38
Seymour 发表于 2022-5-24 16:51
请问交联的聚酰胺力场和初始构型是怎样的呢?

我使用的是GAFF的力场 初始构型经过NPT后 密度在实验范围内
Seymour 发表于 Post on 2022-5-24 16:51:43
请问交联的聚酰胺力场和初始构型是怎样的呢?
hymn 发表于 Post on 2022-5-17 19:46:22
tjuptz 发表于 2022-5-17 10:08
可能交联度不够?

交联度百分之71% 在实验范围内
tjuptz 发表于 Post on 2022-5-17 10:08:49

可能交联度不够?
hymn 发表于 Post on 2022-5-17 09:13:42
tjuptz 发表于 2022-5-13 21:16
你的聚酰胺是交联的吗?

是的
hymn 发表于 Post on 2022-5-17 09:13:30
sobereva 发表于 2022-5-14 00:27
mdp本身没明显问题
大概率是力场参数问题,或者本来就该如此。搜索相关研究文献了解更多信息,包括现象、 ...

好的 谢谢
sobereva 发表于 Post on 2022-5-14 00:27:49
mdp本身没明显问题
大概率是力场参数问题,或者本来就该如此。搜索相关研究文献了解更多信息,包括现象、参数的合理性。
tjuptz 发表于 Post on 2022-5-13 21:16:12
你的聚酰胺是交联的吗?

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