有没有一种可能,就是你这些分子之间的聚合不是由氢键主导的,或者结合的其实没有你想象的那么紧密,所以氢键数量随着时间波动的很厉害。 |
参与人数Participants 1 | eV +5 | 收起 理由Reason |
---|---|---|
| + 5 | 赞! |
华理小妮 发表于 2022-5-22 15:31 因为我有很多个体系,如果都进行扩大,然后重新跑要非常多的时间,具体我也不知道要扩大到多少倍 |
pinpo 发表于 2022-5-18 18:55 我重新多跑了30ns,发现还是不行,不平衡,所以我现在也不知道是什么原因 |
你把体系扩大,时间长点(如果体系不大可以100ns以上),重新计算一下,看看具体什么原因。一般md完成后,分析体系平衡后的相关性质更有意义吧 |
abdoman 发表于 2022-5-18 16:42 CDCA是30个,AM是90个,和实际情况换算的 |
有一点不明白,你的模拟体系里面CDCA与AM分子数目分别是多少? 为什么纵坐标值为60 左右? |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2025-8-14 20:30 , Processed in 0.248390 second(s), 26 queries , Gzip On.