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发布时间: 2022-5-23 13:51

正文摘要:

   对于两个不同的非极性分子靠近的自由能图  软件gromacs2019.6-plumed-ips17   默认质心限制是整个系统消除平动   我发现不需要加熵校正  曲线在0.8nm之后就是 ...

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cmd27 发表于 Post on 2022-5-23 14:44:09
Acee 发表于 2022-5-23 14:15
你好,加这个plumed主要有什么作用

我是分了三段做的自由能曲线   用plumed限制两个分子的质心范围 (比如  4-7nm  6.5-9.5nm  9-12nm)  这样可以快速采样   
Acee 发表于 Post on 2022-5-23 14:15:57
你好,加这个plumed主要有什么作用

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