求助，做径向分布函数时候，ndx文件分组问题

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发布时间: 2022-5-25 10:34

产生的组中，SO是一个硫酸根，我想做Ca2+和硫酸根中氧的径向分布函数，怎么做呀

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小柏桐 发表于 Post on 2022-5-26 09:10:13

sobereva 发表于 2022-5-26 03:38
你当前的界面和你1L的界面根本不是同一个
仔细看清楚屏幕上的提示，当前让你选择组号，又不是make_ndx那 ...

谢谢老师，已解决

sobereva 发表于 Post on 2022-5-26 03:38:24

小柏桐发表于 2022-5-25 16:47
出现了错误

你当前的界面和你1L的界面根本不是同一个
仔细看清楚屏幕上的提示，当前让你选择组号，又不是make_ndx那样能用选择语句

小柏桐 发表于 Post on 2022-5-25 16:29:37

谢谢

Frozen-Penguin 发表于 Post on 2022-5-25 12:50:46

11 & a O
这样可以选中硫酸根里面的氧原子
如果pdb文件里氧原子的名字不是‘O'，把命令里面的’O'改成pdb里面的名称

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