计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 第一性原理 (First-principles) › vesta或者Ms如何显示出特定原子位点所构成的多面体

vesta或者Ms如何显示出特定原子位点所构成的多面体

查看数: 8569 | 评论数: 7 | 收藏 Add to favorites 2

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

莫雨萱

发布时间: 2022-5-25 10:49

正文摘要:

如何利用可视化软件将晶胞中特定原子构成的多面体显示出来呢？

回复 Reply

FanZL 发表于 Post on 2025-4-26 16:04:12

脉冲星射线暴发表于 2022-9-12 16:50
MS的话，在xsd前端显示的情况下右键Display Style，Atom选项卡左侧选Polyhedron。还有个免费软件叫VESTA， ...

请问MS中显示多面体之后化学键消失了，怎么做到多面体和键同时出现啊

莫雨萱 发表于 Post on 2024-11-26 11:35:04

eminem 发表于 2024-11-19 21:32
我在windows 10用vesta大概实现了一下这个需求，感觉这个类似画图还挺好玩的，也简单记录下步骤

哪里 ...

谢谢回复，很详细实用

eminem 发表于 Post on 2024-11-19 21:32:21

本帖最后由 eminem 于 2024-11-19 21:34 编辑

我在windows 10用vesta大概实现了一下这个需求，感觉这个类似画图还挺好玩的，也简单记录下步骤

哪里设置：Ctrl+B调出成键菜单，侧栏Style选择Polyhedral，（可能需要额外Ctrl+Shift+P在Properties-Polyhedra设置一下显示模式）
本质：显示多面体这个需求在vesta就是设置成键构成你想要的多面体，因此成键能构成封闭空间多面体即可。
例子：看附图，假设期望Au3和Au19构成的多面体相接，因此设置好图中比较笨拙的成键条件即可，两个箭头代表多面体到对应的键集合。

202411192124066506..png (309.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

pic.png

脉冲星射线暴 发表于 Post on 2022-9-12 16:50:33

本帖最后由脉冲星射线暴于 2022-9-12 17:58 编辑

MS的话，在xsd前端显示的情况下右键Display Style，Atom选项卡左侧选Polyhedron。还有个免费软件叫VESTA，可以用来画这种图：导入cif然后界面左上角edit-bonds，添加化学键以后勾选Poly就行了

评分 Rate

参与人数 Participants 2	eV +4	收起理由 Reason
ob0327	+ 2	非常感谢
weilu	+ 2	好

查看全部评分 View all ratings

啊这就离谱 发表于 Post on 2022-9-2 15:58:30

本帖最后由啊这就离谱于 2022-9-2 16:14 编辑

先build-bonds，建立合理化学键后就可以显示晶体了。调整化学键范围可以改变多面体的显示

莫雨萱 发表于 Post on 2022-5-25 18:26:25

Jiongci-21 发表于 2022-5-25 16:15
VESTA里
Objects-properties-polyhedra 不知道能否满足你的需求
然后可以自己调节一下显示的化学系键或者 ...

您好，这个方法我试过了，但是调整后并没有显示出文章那种效果，显示上甚至和没调节前没变化，不知道这是什么原因呀？

Jiongci-21 发表于 Post on 2022-5-25 16:15:14

VESTA里
Objects-properties-polyhedra 不知道能否满足你的需求
然后可以自己调节一下显示的化学系键或者原子

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register