sobereva 发表于 2022-6-7 08:35
建议你至少花一万块钱左右买个最低配双路服务器，看下文，要不然中等及以上大小体系构象搜索根本没法做。 ...

哦哦明白啦老师。我其实是超算用户，所以准备按您这个帖子"将多帧xyz文件转化成量子化学输入文件的工具：xyz2QC"的办法，先在自己笔记本上用PM7做初筛，然后像您例子里那样用得到的能量最低的三个构象去超算上进一步筛选。

ReviewReview 发表于 2022-6-6 22:35
昂昂明白啦。Sober老师的template.gjf文件里用的关键词是"# B3LYP/6-31G* em=GD3BJ opt"，然后我的traj.x ...

建议你至少花一万块钱左右买个最低配双路服务器，看下文，要不然中等及以上大小体系构象搜索根本没法做。PM7在笔记本上做初筛还行，要想得到质量靠谱的结果，最后总得DFT结合中小基组优化，再结合大基组算单点，光靠个笔记本完全不够。
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444

wzkchem5 发表于 2022-6-6 22:07
程序会先输出一个空白的isomers.xyz文件，再往里面填东西。从截图看程序还没有算完，如果算完了（或者报错 ...

昂昂明白啦。Sober老师的template.gjf文件里用的关键词是"# B3LYP/6-31G* em=GD3BJ opt"，然后我的traj.xyz文件里是150个构象，每个构象原子数是68，笔记本电脑是四核八线程6代i7CPU，16G内存，这感觉没个300小时算不完，我还是赶紧终止任务换PM7来Opt吧。。。

程序会先输出一个空白的isomers.xyz文件，再往里面填东西。从截图看程序还没有算完，如果算完了（或者报错退出了）以后isomers.xyz还是空白的，那才是有问题。否则就等着它算就行了。