Night5116 发表于 2024-4-4 01:34
想请问下您解决了吗 我也遇到一样的问题了

重新编译即可

想请问下您解决了吗 我也遇到一样的问题了

Peng_ 发表于 2023-11-3 19:43
博主重新编辑解决问题了吗，我也遇到了相同的问题

编译有问题，重新编译一下就好。

876449830 发表于 2022-6-14 09:57
好滴，感谢！我得再重编一下了

博主重新编辑解决问题了吗，我也遇到了相同的问题

highlight 发表于 2022-6-14 08:49
那说明你的 cp2k.popt 实际指向了 ssmp，估计是 alias 或重命名时搞出岔子了
只编译一个版本就好啊，我 ...

好滴，感谢！我得再重编一下了

新版本，默认编译，没有popt
实际上是指向psmp 版本的。

要么用官方提供的docker镜像，
或者使用我修改之后的镜像。
我修改的镜像，用起来很方便。

一知半解，又生搬硬套，当然会有莫名其妙的错误了。

876449830 发表于 2022-6-13 17:18
懂了，感谢解答！那就是我调用的是ssmp版本的，但是我是用cp2k.popt也是一样的诶，这是怎么回事嘞？

那说明你的 cp2k.popt 实际指向了 ssmp，估计是 alias 或重命名时搞出岔子了
只编译一个版本就好啊，我最习惯的还是 psmp

highlight 发表于 2022-6-13 16:45
因为 ssmp 只是 openmp 版本，不是 mpi 版本，mpirun 时就相当于运行了完全一样且独立的四个进程啊
你输 ...

懂了，感谢解答！那就是我调用的是ssmp版本的，但是我是用cp2k.popt也是一样的诶，这是怎么回事嘞？

876449830 发表于 2022-6-13 16:35
还是没懂诶，我用mpirun -np 4 提交同一个任务，我是想让cp2k调用多核跑一个任务呀，但是输出4遍一样的信 ...

因为 ssmp 只是 openmp 版本，不是 mpi 版本，mpirun 时就相当于运行了完全一样且独立的四个进程啊
你输入 date 能输出一次时间，mpirun -np 4 date 是不是就输出了四个？

highlight 发表于 2022-6-13 16:24
跟编译有啥关系
你同时跑了四个作业，还都输出到同一个文件，当然有四个输出了
你也别搞什么 alias ...

还是没懂诶，我用mpirun -np 4 提交同一个任务，我是想让cp2k调用多核跑一个任务呀，但是输出4遍一样的信息，这是什么鬼咯

highlight 发表于 2022-6-13 16:24
跟编译有啥关系
你同时跑了四个作业，还都输出到同一个文件，当然有四个输出了
你也别搞什么 alias ...

还是没懂诶，我用mpirun -np 4 提交同一个任务，我是想让cp2k调用多核跑一个任务呀，但是输出4遍一样的信息，这是什么鬼咯

876449830 发表于 2022-6-13 16:00
对的呀，但是很奇怪输出就有4遍一样的，感觉编译出问题了。

跟编译有啥关系
你同时跑了四个作业，还都输出到同一个文件，当然有四个输出了
你也别搞什么 alias 或改名了，直接

export OMP_NUM_THREADS=4
cp2k.ssmp test.inp |tee test.out
# 或
mpirun -np 4 cp2k.popt test.inp |tee test.out

PoorChaos 发表于 2022-6-13 15:53
如果是按博文 在~/.bashrc里面加入一行alias cp2k='mpirun -np 4 cp2k.popt'
你的运行命令用 cp2k test. ...

对的呀，但是很奇怪输出就有4遍一样的，感觉编译出问题了。

876449830 发表于 2022-6-13 15:08
可是我已经用alias把popt版本简写了诶。

如果是按博文 在~/.bashrc里面加入一行alias cp2k='mpirun -np 4 cp2k.popt'
你的运行命令用 cp2k test.inp |tee test.out不就好了吗