AiYuqing22 发表于 2022-6-18 21:02 谈谈学量子化学如何正确地入门 http://sobereva.com/355(http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html) 参加一次北京科音初级量子化学培训班一次性就全都学明白了,没有比这更好更快的学习方式 |
snljty2 发表于 2022-6-18 10:23 谢谢您的答复。这个是我使用的COF膜的最小结构单元,我计算这个电荷用于MD,膜与其他分子之间我推测存在弱相互作用力,所以加上弥散函数。想继续请教您,带阴离子和不带阴离子计算会有很大差别吗?或者您能提供相关学习路径吗?因为我想和实验有更好的结合,在真实的体系中,阴离子在溶液中很容易被取代,所以我担心溴离子位置的电荷直接-1与真实实验会有偏差。 |
sobereva 发表于 2022-6-18 10:59 谢谢sob老师的答复和您给的帖子。我查看了能量和受力曲线,曲线是整体降低的趋势,所以我判断体系没有震荡,应该是时间不够,可以再跑一段时间。 此外,我想请教您如何看输出的log文件的信息,log文件里面涉及一些专业名词,有哪些是需要着重注意的吗?我自己是做MD的,对高斯的学习大多是来自公社文章和帖子,您推荐的《Quantum Chemistry》和《Exploring chemistry with electronic structure method》也在看,但进度比较慢,如果您能再给一些建议的话就更好了,谢谢您。 |
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注意监控优化过程,别傻等着 量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法 http://sobereva.com/164 |
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优化对所有原子都加弥散毫无必要,如果嫌计算量大,降到2-zeta就行。如果是团簇的话,溴的初始位置明显不合理,徒增优化步数。而且没加色散校正,不合理。 刚又看了一下你的描述,计算RESP的话不要带阴离子,把阳离子单独抠出来就行。剩下的阳离子部分没有必要加弥散。把EmpiricalDispersion=GD3BJ加上,可以换6-31G*优化,再用一个高精度级别的基组计算RESP2电荷即可。 |
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