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高斯opt超过72h,log文件显示一直在cycle,是初始设置不对,还是任务在正常进行中?

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发布时间: 2022-6-18 10:00

正文摘要:

各位老师好!我用高斯opt一个结构(如图1,有共轭体系,是季胺盐,卤素是溴),旨在得到其静电势用于Multiwfn 计算RESP电荷。之前报错不能收敛,参考sob老师解决SCF不收敛问题的方法 - 思想家公社的门口:量子化学· ...

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sobereva 发表于 Post on 2022-6-19 10:17:37
AiYuqing22 发表于 2022-6-18 21:02
谢谢sob老师的答复和您给的帖子。我查看了能量和受力曲线,曲线是整体降低的趋势,所以我判断体系没有震 ...

谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html
参加一次北京科音初级量子化学培训班一次性就全都学明白了,没有比这更好更快的学习方式
AiYuqing22 发表于 Post on 2022-6-18 21:02:27
snljty2 发表于 2022-6-18 10:23
优化对所有原子都加弥散毫无必要,如果嫌计算量大,降到2-zeta就行。如果是团簇的话,溴的初始位置明显不合 ...

谢谢您的答复。这个是我使用的COF膜的最小结构单元,我计算这个电荷用于MD,膜与其他分子之间我推测存在弱相互作用力,所以加上弥散函数。想继续请教您,带阴离子和不带阴离子计算会有很大差别吗?或者您能提供相关学习路径吗?因为我想和实验有更好的结合,在真实的体系中,阴离子在溶液中很容易被取代,所以我担心溴离子位置的电荷直接-1与真实实验会有偏差。
AiYuqing22 发表于 Post on 2022-6-18 21:02:11
sobereva 发表于 2022-6-18 10:59
注意监控优化过程,别傻等着
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

谢谢sob老师的答复和您给的帖子。我查看了能量和受力曲线,曲线是整体降低的趋势,所以我判断体系没有震荡,应该是时间不够,可以再跑一段时间。

此外,我想请教您如何看输出的log文件的信息,log文件里面涉及一些专业名词,有哪些是需要着重注意的吗?我自己是做MD的,对高斯的学习大多是来自公社文章和帖子,您推荐的《Quantum Chemistry》和《Exploring chemistry with electronic structure method》也在看,但进度比较慢,如果您能再给一些建议的话就更好了,谢谢您。
sobereva 发表于 Post on 2022-6-18 10:59:43
注意监控优化过程,别傻等着
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
snljty2 发表于 Post on 2022-6-18 10:23:48
优化对所有原子都加弥散毫无必要,如果嫌计算量大,降到2-zeta就行。如果是团簇的话,溴的初始位置明显不合理,徒增优化步数。而且没加色散校正,不合理。
刚又看了一下你的描述,计算RESP的话不要带阴离子,把阳离子单独抠出来就行。剩下的阳离子部分没有必要加弥散。把EmpiricalDispersion=GD3BJ加上,可以换6-31G*优化,再用一个高精度级别的基组计算RESP2电荷即可。

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