wzkchem5 发表于 2022-6-22 14:46
重新检查一遍氢原子数。先把这个chemdraw结构上所有氢原子都画出来，再对着你的三维分子结构检查，一个原 ...

谢谢老师，检查好了，是autodock tools加氢不合理，用proteinplus在线服务的protoss加完氢检查完就可以正常计算了，再次感谢

shiyunfan 发表于 2022-6-22 05:15
您好，就是有个类药分子，初始结构是这样

做完分子对接后，变成了下图这样

重新检查一遍氢原子数。先把这个chemdraw结构上所有氢原子都画出来，再对着你的三维分子结构检查，一个原子一个原子地检查

wzkchem5 发表于 2022-6-20 16:09
对，而且既不能多补也不能少补，每个重原子该连多少个氢都必须是对的，有一个地方补错了氢的数目都不行

好的，谢谢

shiyunfan 发表于 2022-6-20 08:08
那要补上所有的氢嘛

对，而且既不能多补也不能少补，每个重原子该连多少个氢都必须是对的，有一个地方补错了氢的数目都不行

妙角不脆 发表于 2022-6-20 14:51
你这里把氢给丢了呀，要把氢给补上。不然就会出现你这里这个电子数是奇数但是多重度为0报错的情况。

那要补上所有的氢嘛

你这里把氢给丢了呀，要把氢给补上。不然就会出现你这里这个电子数是奇数但是多重度报错的情况。