护卫天使 发表于 2022-6-22 09:05 先google学术搜搜之前壳聚糖或类似体系MD别人都用大概什么样的模型 xtb完全不适合,一方面跑不动,一方面也不是GROMACS等程序那样适合周期边界条件下结合显式溶剂模型跑动力学的程序。 |
sobereva 发表于 2022-6-22 03:39 好的,谢谢老师。那一般需要建构多少个结构单元,然后在水环境中跑MD?用XTB的半经验法跑MD可否?是不是只要是分析氢键? |
| 光从单体特征看没法予以解释,从微观角度讨论至少也得结合分子动力学 |
sobereva 发表于 2022-6-21 18:15 好的,老师,已上传。 |
| 这样判断极性的问题不大,问题在于极性越高水溶性不是必然越好,其他因素的影响有可能比极性的影响大。 |
| 个人观点:聚合物水溶性与链段交联情况、结晶情况等都有较大的相关性,合成过程中发生的各种复杂变化可能跟初始结构差别真没啥直接联系了,只能提供一个小的视角进行分析。 |
| 把改性前和改性后的结构同时贴出来 |
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