蛋白PDB文件的羧基OXT在Gromacs运行下变成O1和O2

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发布时间: 2022-6-25 16:47

求助！模拟小白，请教一下，蛋白复合物初始PBD的羧基端是OXT，在pdb2gmx后变成了 O1和O2；由于本人想使用gmx_MMPBSA做Decomposition_analysis计算残基的MMPBSA，但是一直报错，如下请问怎么解决，谢谢 ...

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binbinmianba120 发表于 Post on 2022-6-26 08:32:38

真心谢谢您！

sobereva 发表于 Post on 2022-6-26 00:05:21

搞明白tdb文件是干嘛的

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