计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助:VMD无法显示动画

查看数: 3051 | 评论数: 8 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2022-6-26 12:24

正文摘要:

各位前辈师兄好,我将gro文件和xtc文件一起导入到vmd中突然无法显示动画了,之前还好好的可以显示,哪怕是之前已经显示过的也无法显示了,请教各位师兄是什么原因啊? 以下是我的gro文件和xtc文件。

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2022-6-29 01:37:59
吧唧爱吃糖 发表于 2022-6-27 12:55
嗷嗷原来是这样谢谢sob老师,学到了。另外想问一下sob老师,我的作业误操作被取消了,我想用gmx续跑,但 ...

最后一次产生的,即npt.cpt
吧唧爱吃糖 发表于 Post on 2022-6-27 12:55:42
snljty2 发表于 2022-6-26 15:09
看清楼上回复你的new和addfile。

学到了,谢谢前辈。
吧唧爱吃糖 发表于 Post on 2022-6-27 12:55:20
本帖最后由 吧唧爱吃糖 于 2022-6-27 13:27 编辑
sobereva 发表于 2022-6-26 18:18
跟重启毫无关系
你必须把轨迹载入到你载入gro后产生的那个ID里

嗷嗷原来是这样谢谢sob老师,学到了。另外想问一下sob老师,我的作业误操作被取消了,我想用gmx续跑,但是我有几个个cpt文件,一个是npt.cpt另一个是npt_prev.cpt,还有npt_step45401.cpt和npt_step77841.cpt
那我应该-cpi后面用哪个cpt文件那?谢谢sob老师
sobereva 发表于 Post on 2022-6-26 18:18:27
吧唧爱吃糖 发表于 2022-6-26 14:05
已解决,不知道什么原因关机重启就好了。。。

跟重启毫无关系
你必须把轨迹载入到你载入gro后产生的那个ID里
snljty2 发表于 Post on 2022-6-26 15:09:39
吧唧爱吃糖 发表于 2022-6-26 13:54
我就是这样的啊先load的gro在load的xtc

看清楼上回复你的new和addfile。
吧唧爱吃糖 发表于 Post on 2022-6-26 14:05:19
已解决,不知道什么原因关机重启就好了。。。
吧唧爱吃糖 发表于 Post on 2022-6-26 13:54:32
enthalpy 发表于 2022-6-26 13:30
你应该在你导入结构文件pdb或gro等再导入轨迹。 mol new xx.gro; 在导入轨迹 mol addfile xx.xtc

我就是这样的啊先load的gro在load的xtc
enthalpy 发表于 Post on 2022-6-26 13:30:27
你应该在你导入结构文件pdb或gro等再导入轨迹。 mol new xx.gro; 在导入轨迹 mol addfile xx.xtc

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 00:01 , Processed in 0.169850 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list