gromacs 在进行能量最小化时出现一个提示，对后面计算径向分布函数有影响吗

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发布时间: 2022-6-28 21:43

gromacs 在进行能量最小化时出现两个警告，如果忽略对后面计算径向分布函数有影响吗？因为后面有一个分组，不知道有没有影响，如果有影响我要怎么处理呢。希望大佬解答，万分感谢！ PS：（我这个体系 ...

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reddy 发表于 Post on 2022-6-30 08:35:01

sobereva 发表于 2022-6-29 21:01
原子顺序一致即可，原子名不要求一致

好的谢谢社长

sobereva 发表于 Post on 2022-6-29 21:01:45

reddy 发表于 2022-6-29 08:18
好的谢谢那个原子不匹配那个警告忽略影响后面的径向分布函数吗？我看见有13300个原子不匹配 ...

原子顺序一致即可，原子名不要求一致

sobereva 发表于 Post on 2022-6-29 00:53:37

mdp里定义了-DFLEXIBLE，但top里的内容完全展开后没有任何地方指定对定义了FLEXIBLE的情况做什么特殊处理，自然会有这个warning。把mdp里此时无意义的-DFLEXIBLE删了就完了

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