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苯酚和羟基自由基抽氢反应找过渡态不成功

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发布时间: 2022-6-29 16:41

正文摘要:

本帖最后由 liusci 于 2022-6-30 14:53 编辑 已解决问题 。 在此感谢RAL、wzkchem5、sobereva和agent99老师们的回复与指导,收获很大。 首先是需要加极化; 其实是要拉长O H 的距离,之前太短了; 柔性扫 ...

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JCenter 发表于 Post on 2024-11-3 18:35:18
wzkchem5 发表于 2024-11-3 09:26
1. 取复合物更好一些,因为假如反应物是双分子、产物是单分子的话,不好严格定义过渡态离哪个更近
2. 其 ...

感谢老师
wzkchem5 发表于 Post on 2024-11-3 09:26:01
JCenter 发表于 2024-11-2 15:07
老师。想请教您两个问题:
1.Hammond postulate中,是看过渡态的自由能与反应物、产物的自由能之间的差 ...

1. 取复合物更好一些,因为假如反应物是双分子、产物是单分子的话,不好严格定义过渡态离哪个更近
2. 其实就是高中数学内容,一个开口朝下的抛物线,经过两个点(x1,y1)和(x2,y2),且已知抛物线的最高点x3在x1和x2之间,那么当且仅当y1>y2时,|x3-x1| < |x3-x2|。
JCenter 发表于 Post on 2024-11-2 22:07:15
wzkchem5 发表于 2022-6-29 16:59
这个反应是放热反应,根据Hammond postulate,过渡态应该是early transition state,所以羟基氧和苯酚氢的 ...

老师。想请教您两个问题:
1.Hammond postulate中,是看过渡态的自由能与反应物、产物的自由能之间的差距,过渡态会更靠近能量相差更小的一方。在这个过程中,如果反应物或者产物多分子体系的话,在这个假说中,反应物、产物的自由能是指复合物的自由能吗.还是指孤立的分子的自由能之和呢。
2.Hammond postulate是根据啥推出的假说呢,好奇是根据什么理论得到的这个假说。而且,应该不是在所有的过渡态反应中,过渡态的位置都与自由能垒的大小成相关性吧。
liusci 发表于 Post on 2022-6-30 14:46:14
agent99 发表于 2022-6-30 01:41
同楼上,这种反应扫描很好用。另外,既然是水溶液中的反应,反应中心的基团又容易形成氢键,是不是需要加几 ...

柔性扫描确实好用 刚才扫出来了
确实 您说的这个氢键严格说确实不能忽略 以后研究研究
liusci 发表于 Post on 2022-6-30 14:42:21
sobereva 发表于 2022-6-29 20:45
做个O...H逐渐接近的小步长的柔性扫描,若出现极大点且有过渡态的大致模样,以其为初猜

谢谢sob老师! 刚才扫了一下 果然找出来了 感谢!
liusci 发表于 Post on 2022-6-30 06:22:31
wzkchem5 发表于 2022-6-29 16:59
这个反应是放热反应,根据Hammond postulate,过渡态应该是early transition state,所以羟基氧和苯酚氢的 ...

好 我再拉长一些
liusci 发表于 Post on 2022-6-30 06:22:09
RAL 发表于 2022-6-29 16:54
氢转移反应有必要给转移的H原子加极化函数,基组至少应该是6-31G(d,p),参考《谈谈量子化学中基组的选择》3 ...

谢谢 确实我忘了加极化
昨晚跑了试了试 结果是和之前差不多
我再试试应该还有地方不对
agent99 发表于 Post on 2022-6-30 01:41:07
本帖最后由 agent99 于 2022-6-29 11:42 编辑

同楼上,这种反应扫描很好用。另外,既然是水溶液中的反应,反应中心的基团又容易形成氢键,是不是需要加几个显式水分子?
sobereva 发表于 Post on 2022-6-29 20:45:25
做个O...H逐渐接近的小步长的柔性扫描,若出现极大点且有过渡态的大致模样,以其为初猜
wzkchem5 发表于 Post on 2022-6-29 16:59:51
这个反应是放热反应,根据Hammond postulate,过渡态应该是early transition state,所以羟基氧和苯酚氢的距离应该比普通氢转移反应过渡态更远一些,提高20%未必够
RAL 发表于 Post on 2022-6-29 16:54:36
氢转移反应有必要给转移的H原子加极化函数,基组至少应该是6-31G(d,p),参考《谈谈量子化学中基组的选择》3.7 http://sobereva.com/336

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