gromacs中npt模拟以及插入模拟退火设定的问题

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发布时间: 2022-6-29 22:56

本帖最后由 Reisende 于 2022-6-30 12:10 编辑请问大家，我先是在npt中插入模拟退火的的设定： title = NPT ; Run parameters integrator = md nsteps &n ...

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Reisende 发表于 Post on 2022-7-1 15:24:14

Frozen-Penguin 发表于 2022-7-1 13:48
gromacs给出的警告信息中引号里面有空格，一般是不会这样的，可能是里面有无法显示字符，删掉重新输入可能 ...

谢谢，我昨天把空格全都删掉了，然后重新输入一次，问题就莫名其妙的解决了

Frozen-Penguin 发表于 Post on 2022-7-1 13:48:08

gromacs给出的警告信息中引号里面有空格，一般是不会这样的，可能是里面有无法显示字符，删掉重新输入可能可以解决（注意输入法）

Reisende 发表于 Post on 2022-6-30 09:13:53

sobereva 发表于 2022-6-30 00:36
诸如annealing_npoints是annealing-npoints

谢谢社长。
我在自己查错的时候已经试过了，不管中间的是_还是-都会出现这个。
还有想请问社长，我使用相同的npt.mpd模拟两次，模拟出来的压力为什么会不一样呢。而且我多次尝试，好像还会随着我的nstsps的增加，最后得到的average也会增加

sobereva 发表于 Post on 2022-6-30 00:36:29

诸如annealing_npoints是annealing-npoints

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