Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-8-1 17:44
似乎用主功能12的方法算静电势比其他两个快一些，是因为用来了http://sobereva.com/602所说的技巧么？602 ...

Multiwfn的主功能12只需要计算分子表面顶点上的静电势，顶点的总数比起诸如主功能5计算的均匀分布在矩形盒子里的格点数要少（除非用很大的格点间距）。ESPrhoiso不影响主功能17，因为用主功能17做静电势的盆分析必须计算整个空间里所有位置的静电势，而不能只计算特定等值面附近的格点上的静电势来节约时间。

sobereva 发表于 2025-7-16 08:39
是的

似乎用主功能12的方法算静电势比其他两个快一些，是因为用来了http://sobereva.com/602所说的技巧么？602博文说的ESPrhoiso除了对主功能5有效以外，会影响主功能17的结果么？

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-7-15 18:10
编辑：仔细读了前言明白了，正因为用主功能2对静电势做拓扑分析时并不需要先算出其格点数据并保留在内存里 ...

是的

编辑：仔细读了前言明白了，正因为用主功能2对静电势做拓扑分析时并不需要先算出其格点数据并保留在内存里，所以才需要重新用主功能5计算静电势的格点数据来显示等值面。

静电势格点数据有好几个地方可以计算并导出，包括主功能5专门求格点数据时用5 → 12 → {格点选项} → 2所得的totesp.cub、主功能12定量分子表面分析时用12 → 0 → 13所得的mapfunc.cub、主功能17盆分析时用17 → 1 → 12 → {格点选项} → -45所得的basinana.cub。要从几种方式获得比较统一的结果，是不是只要控制格点间距和延展距离之类的一致就可以了？

sobereva 发表于 2023-3-17 22:44
跟是否是平面中心对称没直接关系，文中的做法是普适的。
搞不清楚的话，可以通过等值图（反复调节isoval ...

好的，我再试试

xinyanli 发表于 2023-3-17 20:09
老师，是不是平面中心对称的分子无法用盆分析和拓扑分析联用找极小点？我发现如果先用盆分析找了极小点后， ...

跟是否是平面中心对称没直接关系，文中的做法是普适的。
搞不清楚的话，可以通过等值图（反复调节isovalue）确认极小点实际位置到底在哪

老师，是不是平面中心对称的分子无法用盆分析和拓扑分析联用找极小点？我发现如果先用盆分析找了极小点后，再通过拓扑分析找极小点导出的CPs.pdb文件中没有一个极小点。这种情况是不是盆分析就足够找到极小点了？