我想请教一下这个最开始的MOF晶胞是怎么建立的啊 我cif导入特别大 用MS软件精简那个也很大 自己一点点删出来最后成为一个团簇 不知道怎么建成晶胞

卡开发发 发表于 2022-7-19 13:43
你提到的文中细节我不太明确，也不是我所擅长的问题，建议咨询其他老师。

感谢老师回复，我主要是想知道这个图片上说的方法是指什么。

wyqms 发表于 2022-7-19 10:11
老师您好，我看了这篇论文有几个小问题想要请教，因为只是个小疑惑就不开贴子，直接在这咨询您了。这篇论 ...

你提到的文中细节我不太明确，也不是我所擅长的问题，建议咨询其他老师。

卡开发发 发表于 2022-7-8 07:47
可以算，应该在Properties-Potential还是具体哪个性质你可能找找看。

老师您好，我看了这篇论文有几个小问题想要请教，因为只是个小疑惑就不开贴子，直接在这咨询您了。这篇论文提到用高斯计算电荷后，同类型进行平均，然后再应用到整体，这个操作是怎么进行的呢，而且论文构建的片段中用来替换和补齐的原子其电荷如果不考虑的话，那么返回到整体的电荷应该会导致整体不呈现电中性吧？

文申的量子化学 发表于 2022-7-15 18:24
卡老师我有个疑问，就是scf收敛误差4mev/atom怎么看啊

就是比这个标准小，该在那看啊

卡开发发 发表于 2022-7-8 07:47
可以算，应该在Properties-Potential还是具体哪个性质你可能找找看。

卡老师我有个疑问，就是scf收敛误差4mev/atom怎么看啊

wyqms 发表于 2022-7-7 14:31
老师您好，关于这个静电势分析，castep能计算吗，如果可以的话怎么得到呢

可以算，应该在Properties-Potential还是具体哪个性质你可能找找看。

卡开发发 发表于 2016-4-20 10:18
1、在性质计算中勾选Elecrostatics即可，分析的时候在Analysis->Potentials->impose导出格点数据到xsd， ...

老师您好，关于这个静电势分析，castep能计算吗，如果可以的话怎么得到呢

好的，谢谢老师！

哈哈宝 发表于 2016-4-21 14:38
@开发卡卡 老师，谢谢您的回复，我放宽tolerance找到对称性为C2，之后得到原胞是这样的，我想再重新优化一 ...

不建议对称性的tolerance放得太宽，有可能不可靠，实在不行你就单胞做就行了。

哈哈宝 发表于 2016-4-21 08:23
@开发卡卡 老师，我晶体的原始cif文件如下。
1. 我觉得没有对称性，primitive cell那项是灰色的，无法转换 ...

1、对称性是有的，不过可能原胞就是单胞，找完对称性之后在一个site上话其他的对称就会显示出来，但是CO2吸附在什么样的位置你得自己考虑一下；
2、SCF没收敛是自然不会计算Electrostatic的，你这样，你先保持其他计算参数，把density mix的charge降到0.05，我试了一下可以收敛，结构优化过后再降低现有的smearing；
3、要上传文件夹，直接再文件夹运行RunDMol3就行，比如car文件等是隐藏文件。

哈哈宝 发表于 2016-4-20 13:42
非常感谢卡开发发老师。我是菜鸟一个。
该图就是作者说加入了18个周期的CO2，来预测位点，认为在Co原子附 ...

作者可能是利用了对称性来建立模型的，我倒是建议你可以先把结构转化成原胞（primitve cell）看看有几个不等价的Cu的site，然后再看下一步处理。

你也可以把结构发过来瞧一下。