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高斯使用不了全部36个核心

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发布时间: 2022-7-8 21:03

正文摘要:

在用高斯16 A计算激发态时,运行的核心数会自动减少至24个,求助! 没有写内存限制,因为加了%mem后出现link died,只好删了;CPU是双路E5 2696 v3; %nprocshared=36 %chk=D:\KJY\amideTDDFT1.chk # CAM-b3lyp/ ...

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paramecium86 发表于 Post on 2022-8-11 08:56:59
lanthanum 发表于 2022-8-3 14:10
按那个帖子重复不出来,楼主tjchkj也很久没上论坛了。
我的也跑不满,怀疑是openMP的事。
不管并行效率 ...

我自己尝试过。超过64线程的的双U平台(比如2* 2696v3 开了超线程后就是72线程),用高斯win版的时候无论怎么写nproc 都只能使用其中一个CPU。这个应该是win版的问题。 如果再bios里吧超线程关掉,整个平台就只有36线程了,那再使用win版的高斯就可以正常调用2个CPU同时工作。 不过效率也还很堪忧的。即使都用上双CPU,比如0397任务大概也只有LINUX下同核心数的1/3速度。

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sobereva 发表于 Post on 2022-8-11 07:37:41
lanthanum 发表于 2022-8-3 14:10
按那个帖子重复不出来,楼主tjchkj也很久没上论坛了。
我的也跑不满,怀疑是openMP的事。
不管并行效率 ...

Windows下的Gaussian就甭考虑了

Linux下如果也有那种问题,尝试调整%CPU,参考http://sobereva.com/392
lanthanum 发表于 Post on 2022-8-3 14:10:40
康康SCU 发表于 2022-7-14 19:37
谢谢老师,之前已经看过了,http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html这里建议用Linux跑,打算学习L ...

按那个帖子重复不出来,楼主tjchkj也很久没上论坛了。
我的也跑不满,怀疑是openMP的事。
不管并行效率如何,即使写%nprocs=64,也只能用一个cpu的36核,另一个cpu闲着,这明显是有问题的。
请看私信,我们讨论一下这个问题。谢谢。

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康康SCU 发表于 Post on 2022-7-14 19:38:39
liyuanhe211 发表于 2022-7-8 22:51
先排除:内存太少(默认只有800 MB)导致不够分,体系太小导致不用分。

Default.Route文件给了高斯默认100GB内存,发现只使用了2GB不到,打算学习下Linux再试试。
康康SCU 发表于 Post on 2022-7-14 19:37:39
sobereva 发表于 2022-7-9 04:22
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439(http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1 ...

谢谢老师,之前已经看过了,http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html这里建议用Linux跑,打算学习Linux系统高斯的使用。
不过http://bbs.keinsci.com/thread-7472-1-1.html这个帖子写了windows系统下高斯16的使用,是可以跑满的,就很奇怪。
康康SCU 发表于 Post on 2022-7-14 19:33:19
yjb 发表于 2022-7-9 00:15
在默认设置里面把内存给多点,给80GB.

嗯,设置了Default.Route文件将默认内存给到了100GB,重复了下还是只有不到一般的核心在跑,在学习用Linux计算了,谢谢。
sobereva 发表于 Post on 2022-7-9 04:23:05
康康SCU 发表于 2022-7-8 21:05
高斯里有行描述是 requested number of processors reduced to: 25 ShMem   1 Linda.

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。
sobereva 发表于 Post on 2022-7-9 04:22:25
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html

仔细把此文看了就没疑问了,而且也不会再做出用Windows版Gaussian上用几十个核并行这种事。
yjb 发表于 Post on 2022-7-9 00:15:37
在默认设置里面把内存给多点,给80GB.
liyuanhe211 发表于 Post on 2022-7-8 22:51:39
先排除:内存太少(默认只有800 MB)导致不够分,体系太小导致不用分。
康康SCU 发表于 Post on 2022-7-8 21:05:48
高斯里有行描述是 requested number of processors reduced to: 25 ShMem   1 Linda.

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