求助：使用命令行运行Sobtop产生top文件的小BUG

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发布时间: 2022-7-11 22:30

本帖最后由 wangyueda 于 2022-7-11 22:35 编辑请问下卢老师，我在Linux下使用Sobtop生成top文件时将相关命令写成Shell脚本，结果运行发现gro,itp文件产生正常，但是top文件没有产生，进一步检查发现原本文件 ...

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sobereva 发表于 Post on 2022-7-14 15:53:53

wangyueda 发表于 2022-7-14 14:46
好的老师问下按我写的这个Shell脚本为啥会将fchk文件替换为top文件？

应该是对换行符的识别问题，导致让输入top文件路径那一步输入的是fchk文件路径。
\n作为按回车，也不适合写在命令前头

wangyueda 发表于 Post on 2022-7-14 14:46:22

sobereva 发表于 2022-7-14 10:31
弄成一行写
echo -e "EC-opt.mol2\n7\n10\nEC-RESP2-0.5.chg\n0\n2\n\n-1\n4\n1\n2\n2\nEC-opt.fchk\n\n\n ...

好的老师问下按我写的这个Shell脚本为啥会将fchk文件替换为top文件？

sobereva 发表于 Post on 2022-7-14 10:31:35

弄成一行写
echo -e "EC-opt.mol2\n7\n10\nEC-RESP2-0.5.chg\n0\n2\n\n-1\n4\n1\n2\n2\nEC-opt.fchk\n\n\n0" | ./sobtop |tee EC-top.txt

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