zjxitcc 发表于 2025-7-17 19:59 谢谢老师的解答！老师的意思是对于这种多环芳烃的结构难以直接划分出分子片段，不适合通过能量分解去量化分子片段的相互作用，不知道我的理解是否有误？ 那我是否可以采用其他方法间接量化作用力的强弱，比如AIM临界点电子密度。 注：这两个片段间同时存在静电引力（羰基和胺）和立体排斥（原子距离小于范德华半径和）相互作用 |
fy_111 发表于 2025-7-17 18:58 不合理。这个问题不在于使用哪种EDA方法，而在于你这么划分是否合理，是否能研究你的问题。打个不太恰当的比方，你要用电锯割小麦，我说用电锯不合适，你反过来问我你该用哪个牌子的电锯。 |
zjxitcc 发表于 2025-7-17 18:39 老师，那采用“使用Multiwfn做基于分子力场的能量分解分析 http://sobereva.com/442 ”这个方法是不是更合理呢？基于分子已经优化好的电子结构去分析，不存在额外的片段计算。 |
fy_111 发表于 2025-7-17 16:36 这个划分片段的方式看起来有点粗暴，连共轭环都切了，建议到PSI4官方论坛提问https://forum.psicode.org/。如果有其他手段可以研究你的问题，应当优先选择其他更恰当的手段，否则结果变成“你敢算、审稿人不敢信”，那最后也是白忙活。 |
zjxitcc 发表于 2022-7-26 10:59 老师您好，看到您关于片段划分的回复，我意识到我最近在使用PSI的F/I-SAPT时一直报错的原因可能和片段划分不合理有关，特此想请老师帮忙看一下我重新划分的片段（如图：黄、绿、灰三个片段，分别在红色虚线处断键）及电荷及自旋多重度的设置（三个片段分别为：0 1，0 1，0 1）是否合理，谢谢老师！ |
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片段划分
星斗如盘 发表于 2022-9-25 18:04 |
zjxitcc 发表于 2022-9-25 18:01 谢谢，大体系只能用超算了，请问100个原子级别，使用PSI4进行EDA时，一般推荐什么级别进行计算呢？（如果超算性能够的话） |
星斗如盘 发表于 2022-9-25 17:59 所有量化程序都遵从memory内存，disk硬盘 |
zjxitcc 发表于 2022-7-24 22:06 请教一下，PSI4的memory指的是运行内存，还是硬盘容量？ |
Luckynan 发表于 2022-7-26 10:50 少氢的方式太离谱了，片段2含奇数个电子，不可能是单重态。能量分解有很多种方法，但无论做哪种，大前提都是片段的几何结构、电荷和自旋多重度要合理设置，不能随意切键、指认，即使程序不报错，算出来也未必合理。 你当前的目的适合F-SAPT或I-SAPT，见https://psicode.org/psi4manual/master/fisapt.html 又或GKS-EDA（划分成3个片段），见《GKS-EDA计算简介》。 |
zjxitcc 发表于 2022-7-25 17:21 好的，因为这两个片段都是在一个化合物上截取出来的，因此看起来少氢。我是想分析一个化合物上的两个结构之间的SAPT分析，该如何修改输入文件呢？ |
Luckynan 发表于 2022-7-25 16:11 （1）想回复他人，应该在对应楼层点击“回复”，否则别人不会收到回复消息； （2）你的两个片段结构有问题，结构似乎都少了（>=1个）氢原子。 |
| （1）报错内容没有（正确地）展示出来；（2）10GB内存太少了，少说100GB。 |
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