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production simulation中间出现One or more water molecules can not be settled.

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CruiseBend

发布时间: 2022-7-25 00:40

正文摘要:

膜蛋白体系，在100ns production simulation中间30-60ns出现LINCS warning-One or more water molecules can not be settled. 非常诡异，之前模拟从来没有遇到过，发现出现问题的原子是在盒子边的POPC链上的原子；续 ...

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sobereva 发表于 Post on 2022-7-25 02:11:31

该说的http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8里都说了
确保拓扑文件无误的情况下，先尝试用1 fs步长看看情况

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