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用gromacs做完分子模拟,然后做脂膜deuterium order parameters分析,结果好坏如何看

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发布时间: 2022-7-25 10:14

正文摘要:

各位大佬,我用genmixmem构建出混合脂膜,然后做了分子模拟,之后又对其中一种脂质的sn1和sn2做了deuterium order parameters分析,结果如下图,“KALP15 in DPPC“的分析如第二幅图,感觉我自己做的波动很大,请问 ...

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CruiseBend 发表于 Post on 2022-7-26 13:54:22
注意Scd的定义,如果定义seta角是CH和z轴的夹角的话,正常的Scd应该也就是0-0.4之间,你这种图形很有可能是lipid还没有平衡,或者是平衡了取了没平衡段算的

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