sobereva 发表于 2022-8-5 08:20
可以改用VMD自带的volmap tool产生格点数据，还能同时考虑平滑化

好的，多谢老师

wwl 发表于 2022-8-4 11:50
多谢sob老师，我检查了所有的过程，原点、格点数、格点间距都是一样的。整个过程也严格按照手册里的过程 ...

可以改用VMD自带的volmap tool产生格点数据，还能同时考虑平滑化

sobereva 发表于 2022-8-4 02:25
两个cube文件的原点、格点数、格点间距都统一了，自然就会“同框”
检查gmx spatial的使用过程。

多谢sob老师，我检查了所有的过程，原点、格点数、格点间距都是一样的。整个过程也严格按照手册里的过程。
我分析了多个组，最后发现这个框线应该不是模拟系统的盒子线，而是统计的这些原子点的坐标截止面，因为分析的多个组显示这些框线的长宽高都不怎么一致，但是都截止在统计的该组最边缘原子的边界。

两个cube文件的原点、格点数、格点间距都统一了，自然就会“同框”
检查gmx spatial的使用过程。