如何对一段轨迹时间的构象进行平均

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DSF

发布时间: 2022-8-4 20:04

在使用average进行平均的时候出现了构象扭曲（disorder）的情况。不知道这样的情况应该如何解决，amber手册里面写的是rms去处理global rotational和translation movement。但是我rms处理过后average还是会有扭曲的情 ...

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enthalpy 发表于 Post on 2022-8-4 20:51:18

可以用类似中心结构。比如做聚类分析，找出最大类当中的中间结构。

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