求助：文献中关键氨基酸残基贡献度是怎么计算的

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发布时间: 2022-8-8 14:03

动力学优化结果显示，布加替尼与ＲOS1 蛋白中 Lys1980 以及Met2019 氨基酸残基具有较强的氢键结合作用，此外还与Ala1918 和Leu2086 形成稳定的疏水作用( 见图 2B) 。布加替尼与ＲOS1 的相互作用模式( 见图2C、D ...

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angelhunte 发表于 Post on 2022-8-10 10:55:11

sobereva 发表于 2022-8-10 07:40
什么叫形成了疏水作用，没有唯一的、有共识的判据。仔细看文章里的说明，没写清楚的话就发邮件问作者
至于 ...

谢谢老师的耐心回复

sobereva 发表于 Post on 2022-8-10 07:40:11

什么叫形成了疏水作用，没有唯一的、有共识的判据。仔细看文章里的说明，没写清楚的话就发邮件问作者
至于氢键的存在性，通常用几何标准判断，gmx hbonds就可以分析

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