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求助：gromacs运行一段时间过后，计算速度显著下降

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Tttgb

发布时间: 2022-8-9 16:25

正文摘要:

任务提交的脚本如下： #PBS -q core40 #PBS -l mem=30gb,walltime=1999:00:00,nodes=1:ppn=4 #HSCHED -s TEST #PPN limit 4 cd /path/to/gromacs_test gmx_mpi mdrun -deffnm md_0_1 -s md_0_10.tpr -cpi md_ ...

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sobereva 发表于 Post on 2022-8-10 06:58:23

不用MPI而用thread_MPI+OpenMP方式并行再试。单节点并行强烈不建议用MPI并行

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